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[配置讨论] 用于分子模拟和简单量化模拟服务器配置咨询

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各位老师,请教一下,本人主要用分子模拟方法研究多孔材料的吸附分离性能,即主要用来跑MC和MD任务,还会进行一些简单的量化计算,比如计算电荷、结合能等。预算在2W左右,是否可以用Sobereva老师推荐的“较好双路服务器推荐配置”,即:


CPU:2* XEON E5-2696 v3(18核2.3G,散,无集显)2*3900
散热器:酷冷至尊T400i*2  80*2
主板:超微 X10DRL-I(C612芯片组,集显) 1700
硬盘:希捷ST4000NM0033企业级4TB SATA 600
内存:三星DDR4-2400 ECC 8*16GB   8*550
电源:海韵S12II-620(额定620W)或 台达NX650(额定650W) 皆530
机箱:先马泰坦豪华黑 290


请问,如果不是很合适的话,哪里需要进行改动呢?
谢谢。

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发表于 Post on 2019-9-30 18:03:26 | 只看该作者 Only view this author
加1张rtx2060以上级别的显卡,电源换成台达800W以上的,钱够多的话,散热器换成猫牌的,其他的照抄社长的即可。

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发表于 Post on 2019-10-1 02:40:15 | 只看该作者 Only view this author
着看你用什么程序做分子模拟
如果支持GPU加速,建议上RTX 2080或RTX2080 SUPER,性能能提升很多。届时建议上个1000W电源。关于GPU加速该用什么卡、该用什么电源,文中已经说了
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-10-6 09:29:12 | 只看该作者 Only view this author
qinzhong605 发表于 2019-9-30 18:03
加1张rtx2060以上级别的显卡,电源换成台达800W以上的,钱够多的话,散热器换成猫牌的,其他的照抄社长的即 ...

谢谢,明白了

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-10-6 09:30:15 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-10-1 02:40
着看你用什么程序做分子模拟
如果支持GPU加速,建议上RTX 2080或RTX2080 SUPER,性能能提升很多。届时建议 ...

打算用北化的一个老师编写的CADSS来进行计算。
谢谢sob老师指导

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发表于 Post on 2019-10-6 11:18:49 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-10-1 02:40
着看你用什么程序做分子模拟
如果支持GPU加速,建议上RTX 2080或RTX2080 SUPER,性能能提升很多。届时建议 ...

"RTX 2080或RTX2080 SUPER"和1080ti,从性价比来说,哪个好?
主要用于GPU跑MD

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发表于 Post on 2019-11-28 23:27:26 | 只看该作者 Only view this author
mangix 发表于 2019-10-6 09:30
打算用北化的一个老师编写的CADSS来进行计算。
谢谢sob老师指导

北化的哪位老师?

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发表于 Post on 2019-11-29 10:01:52 | 只看该作者 Only view this author
ezez 发表于 2019-10-6 11:18
"RTX 2080或RTX2080 SUPER"和1080ti,从性价比来说,哪个好?
主要用于GPU跑MD

1080Ti现在都没新货了
买2080
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发表于 Post on 2019-11-29 13:08:25 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-11-29 10:01
1080Ti现在都没新货了
买2080

谢谢社长

那1080Ti和2080在GPU加速跑MD方面的差别如何?

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发表于 Post on 2019-11-30 03:17:36 | 只看该作者 Only view this author
ezez 发表于 2019-11-29 13:08
谢谢社长

那1080Ti和2080在GPU加速跑MD方面的差别如何?

这里有gromacs下的对比
https://openbenchmarking.org/result/1901228-SK-1812259PT23
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发表于 Post on 2019-11-30 11:19:46 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-11-30 03:17
这里有gromacs下的对比
https://openbenchmarking.org/result/1901228-SK-1812259PT23

看来2080似乎更优一筹,谢谢社长~

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发表于 Post on 2019-11-30 22:48:27 | 只看该作者 Only view this author
ezez 发表于 2019-10-6 11:18
"RTX 2080或RTX2080 SUPER"和1080ti,从性价比来说,哪个好?
主要用于GPU跑MD

贵的好

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发表于 Post on 2019-12-1 11:31:52 | 只看该作者 Only view this author

恩,有道理~~~

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