计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 832|回复 Reply: 2
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Molpro] 求助molpro以CCSD(T)方法计算过渡态问题

[复制链接 Copy URL]

232

帖子

0

威望

1166

eV
积分
1398

Level 4 (黑子)

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
想要用CCSD(T)方法计算小尺寸团簇之间转换的过渡态,
根据在官网上改进得到的输入文件为:
***,OCH2 ! 标题
memory,1000,m


basis=aug-cc-pvdz ! 使用Pople基组  

symmetry,nosym  
geom={   

}                                                                                    

hf                       ! HF-SCF

frequencies,analytical   ! Vibrational frequencies for HF-SCF (analytical Hessian)

charge=1
ccsd(t)

optg,root=2,method=rf,readhess   !Transition state optimization for ccsd(t)

frequencies              ! Vibrational frequencies for CCSD(T) (numerical Hessian)

根据在网站上看到beefly老师对另一位同学的回复,

具体回复为:
caspt2没有解析hessian,算数值hessian比较慢,而且不能利用对称性。可以用其它方法产生数值或解析hessian,提高效率。例如用hf,dft。如果是这些方法不适用的体系,也可以用小基组、小活性空间的caspt2。

首先在一个低阶方法优化的过渡态产生hessian。输入:
***, generate initial hessian for transition state optimization
memory,1000,m
file,2,hessian.dat

geometry={
...
}

BASIS={
...
}

{rks,b3lyp3;}

{optg,ROOT=2,maxit=1;}
---

hessian默认被存到2号文件,所以要给2号文件命名,以后使用。因为只需要该点的hessian,一步优化就可以(maxit=1)。察看输出文件,找到存放hessian的具体位置(例如,5302.2)。

在同样的初始过渡态结构,用caspt2做优化的时候,不要升级hessian文件(NOHESS)。另外,为了避免和caspt2的新2号文件冲突,上一步的存有hessian的2号文件改为3号,5302.2也改为5303.3。输入:

***, transition state
file,3,hessian.dat;
memory,2000,m

geometry={
...
}

BASIS={
...
}

{HF;
...}

{MULTI;
...
}

{rs2c;
...
}

{optg,ROOT=2;HESSIAN,HESSREC=5302.3;
METHOD,QSD,NOHESS;}
---

优化结束后,人工控制hessian的更新。这需要在新的过渡态重复第一、第二个计算。直到第二个计算中的结构不再更新。一般需要3~5次。

发现还存在QSD方法,我目前使用的貌似是rf方法,请问这两种方法有什么区别和优劣吗?在过渡态、反应路径的计算方法及相关问题 - 思想家公社的门口:量子化学·分子模拟·二次元 (sobereva.com)并未没看到这两种方法,是molpro独有的吗?


还有就是看可以先用相对粗糙方法计算HESSIAN再根据得到的hessian进行计算,想问这种方法对结构会产生影响吗?影响大吗?

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112492

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2023-7-20 13:10:45 | 只看该作者 Only view this author
算过渡态用CCSD足矣。是我的话就用Gaussian做,用着又方便又有解析梯度。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

232

帖子

0

威望

1166

eV
积分
1398

Level 4 (黑子)

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-7-27 09:56:59 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-7-20 13:10
算过渡态用CCSD足矣。是我的话就用Gaussian做,用着又方便又有解析梯度。

收到,谢谢老师

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-27 00:31 , Processed in 0.155757 second(s), 21 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list