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[Amber] 请教:Amber通过Gaussian调用xtb的问题

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楼主
用Amber18调用Gaussian 09跑QM/MM MD,速度太慢,16核1.7ps/day。
我就想起用社长开发的Gaussian调用xtb的工具,从前使用过,运行没问题。所以我想用Amber调用g09,g09再调用xtb,方法是在“gau_job.tpl”文件中写上 # external='./xtb.sh'  (此外什么都没写)。
运行之后秒报错退出,错误信息是:
Generating mol.tmp
Generating mol.xyz via genxyz
Running: xtb mol.xyz -P 4 --chrg -2 --uhf 0 --grad > xtbout
xtb running finished!
Extracting data from xtb outputs via extderi
Recovered energy= -94.2732038000     dipole=      0.000000000000      0.000000000000      0.000000000000
Energy=    -94.2732038     NIter=   0.
Dipole moment=       0.000000       0.000000       0.000000
Unabled to recover density for method  0
Error termination via Lnk1e in /home/soft/g09/g09/l602.exe at Mon Dec 23 23:19:04 2019.

Job cpu time:       0 days  0 hours  0 minutes  0.7 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=      5 Int=      0 D2E=      0 Chk=      1 Scr=      1


sander的.out文件末尾报错:
   4.  RESULTS
--------------------------------------------------------------------------------
SANDER BOMB in subroutine get_gau_forces (qm2_extern_gau_module)
Error with system call (executing Gaussian)

Will quit now.


检查了sander生成的gau_job.inp,关键词是:
# external='./xtb.sh' NoSymm Force Charge Prop=(Field,Read)
跟直接调用g09的关键词相比,似乎没有什么异常。


请问这是什么原因?有没有老师试过这种调用方法?
多谢


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发表于 Post on 2019-12-23 23:52:32 | 只看该作者 Only view this author
之前论坛里有专门的帖子
http://bbs.keinsci.com/thread-15304-1-1.html
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-12-23 23:58:32 来自手机 | 只看该作者 Only view this author
谢谢社长,之前看过那个帖子,只是orca和xtb编译都不熟悉,怕麻烦所以想用gaussian来调用

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-12-23 23:59:32 来自手机 | 只看该作者 Only view this author
这么说,通过gaussian来调用xtb怕是行不通了

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发表于 Post on 2019-12-24 06:54:58 | 只看该作者 Only view this author
ORCA本来就不需要编译。
xtb的编译看
Grimme的xtb程序的编译方法
http://sobereva.com/521
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-12-24 09:16:24 来自手机 | 只看该作者 Only view this author
多谢社长,我试试看

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