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[配置讨论] cp2k跑1000个原子的振动分析需要什么配置

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本帖最后由 stishovite 于 2024-5-23 18:23 编辑

本人最近刚开始学习第一性原理计算,对于计算的硬件需求完全没有概念。


我需要用cp2k跑1000个原子体系的振动分析,主族元素,PBE/DZVP-MOLOPT-SR-GTH,请问什么样的配置可以在20个小时以内跑完。

全套价格当然是越低越好,预算不超过2w可以搞定吗?请大家帮忙支招。

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发表于 Post on 2024-5-23 17:17:23 | 只看该作者 Only view this author
不说计算级别问这个没意义。诸如GFN-xTB级别跑,几千块钱的二手2*E5-2696v3都完全能跑得动
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-5-23 18:05:26 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-5-23 17:17
不说计算级别问这个没意义。诸如GFN-xTB级别跑,几千块钱的二手2*E5-2696v3都完全能跑得动

社长你好,我主要用PBE/DZVP-MOLOPT-SR-GTH算主族元素

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发表于 Post on 2024-5-24 04:32:29 | 只看该作者 Only view this author
买双路7R32+512GB机子
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淘宝上购买的双路EPYC 7R32 96核服务器的使用感受和杂谈
http://sobereva.com/653
计算化学购机配置推荐
http://sobereva.com/444
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-5-24 21:18:36 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-5-24 04:32
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谢谢社长的回复,您推荐的方案很好,计算化学购机配置推荐http://sobereva.com/444的文章也读了好几遍了,唯一的问题就是2w的价格超预算了。

麻烦再问社长,及各位坛友,有没有单路48核或64核心,价格1.5w左右的方案推荐。

先谢谢大家。

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发表于 Post on 2024-5-25 09:40:50 | 只看该作者 Only view this author
stishovite 发表于 2024-5-24 21:18
谢谢社长的回复,您推荐的方案很好,计算化学购机配置推荐http://sobereva.com/444的文章也读了好几遍了 ...

整个单路7B13
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发表于 Post on 2024-6-24 20:06:21 | 只看该作者 Only view this author
哥们这几乎不可能。我最近在跑的一个体系,约370个原子,冻结大部分非涉及反应原子,剩下了100个原子跑极度耗时的振动分析也要一两天的时间,用的是课题组师兄按照sob老师推荐的96核双路服务器。总结一下,3万多的服务器,计算级别跟你一样,体系370个原子,冻结绝大部分跑振动分析也至少需要一天。除非你冻结更多的原子或者用更低的级别算,否则完全算不动

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-6-27 08:41:25 | 只看该作者 Only view this author
天水丨伯约 发表于 2024-6-24 20:06
哥们这几乎不可能。我最近在跑的一个体系,约370个原子,冻结大部分非涉及反应原子,剩下了100个原子跑极度 ...

谢谢哥们分享信息!是的,96核,算是能算动,就是耗时太长,我是刚刚学习第一性原理计算,最近想着从软件优化能否在扣一点性能出来。

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发表于 Post on 2024-7-25 22:42:03 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-5-24 04:32
买双路7R32+512GB机子
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Sob老师,请问7R32双路这个配置,跑VASP LAMMPS效率还可以吗?

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发表于 Post on 2024-7-25 23:05:58 | 只看该作者 Only view this author
如果是一点冻结都不做,你这个要求得几十到几百W才可能实现

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发表于 Post on 2024-7-26 03:58:00 | 只看该作者 Only view this author
1906593216 发表于 2024-7-25 22:42
Sob老师,请问7R32双路这个配置,跑VASP LAMMPS效率还可以吗?

可以
lammps最好GPU加速跑
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发表于 Post on 2024-7-29 09:50:15 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-7-26 03:58
可以
lammps最好GPU加速跑

用显卡 RTX 3080 10GB大概5000多块钱左右够用的吗?

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发表于 Post on 2024-7-30 05:38:35 | 只看该作者 Only view this author
1906593216 发表于 2024-7-29 09:50
用显卡 RTX 3080 10GB大概5000多块钱左右够用的吗?

凑合
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