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[新手求助] 乙醇离子初始结构优化问题

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本帖最后由 Machaophy 于 2020-3-17 17:07 编辑

分别用:CCSD/def2TZVP,M062x/def2TZVP,M062x/6-311++G(2df,2pd),B3LYP/6-311++G(2df,2pd)  四种不同的方法与基组对乙醇一价阳离子(CH3CH2OH+)做了结构优化,但是发现CCSD/def2TZVP 与其他的三个方法优化出来的结构都不相同。结果如图1和图2所示,M062x/def2TZVP,M062x/6-311++G(2df,2pd),B3LYP/6-311++G(2df,2pd)  三种方法优化出来的C与C之间的距离被拉伸至约1.73左右,似乎有些不合理?  而CCSD/def2TZVP优化出来的C-C键为1.49495,与NSIT得到的中性乙醇分子C与C之间的距离1.51970接近;
为了确定CCSD的准确性,我做了T1诊断,最后得到的值为 T1 Diagnostic =     0.03418264;
(第一次做T1诊断,在输出文件里有4个值,都在0.03左右,我取了最后一个值,应该对吧?)


个人认为,CCSD方法算出来的应该更加可信一些,但这是一个很小很简单的体系,四种方法优化的结构理论上应该相差不大才对,想问一下大家,目前看来结构相差还是很明显的,不知道问题出在哪里了...?
谢谢您的帮助。



图2.png (120.44 KB, 下载次数 Times of downloads: 13)

图1

图1

图1.png (107.66 KB, 下载次数 Times of downloads: 15)

图2

图2

CCSD(T1diag)_def2TZVP.gjf

660 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 7

B3LYP_6311++G(2df,2pd).gjf

665 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 4

M062x_def2TZVP.gjf

661 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 3

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发表于 Post on 2020-3-17 20:45:41 | 只看该作者 Only view this author
你输入的结构有Cs点群对称性,而乙醇阳离子自由基想来可能没有这个对称性,好像应当是C1。你密度泛函的三个结果都是C1点群,而CCSD保持了Cs点群,有可能是因为输入对称导致结构优化在一个鞍点上了(也就是如果CCSD有解析频率,你算你CCSD的结构应该有一个虚频,虚频的振动方向是破坏Cs对称性的方向)。可以尝试把你DFT的结构做为初猜给CCSD重新优化,看是否得到与DFT接近的结果、且比现在CCSD的结果能量低;也可以把CCSD现在的初猜的对称性破坏了重新优化。

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发表于 Post on 2020-3-17 21:42:01 | 只看该作者 Only view this author
这么简单的一个体系之前应该有很多计算,并且有不少相关的实验光谱数据,可以参照一下
从结构上来说,DFT的应该更合理一点(即C-C变长);另外既然你手头就有中性的实验信息,何不做个计算看一下中性计算与实验的吻合程度?这么小的体系,应该是很快的事儿。

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发表于 Post on 2020-3-18 14:06:10 | 只看该作者 Only view this author
你的输入文件里做了振动分析但是你的描述里却没提振动分析,看看都有没有虚频。最好是直接把输出文件都压缩后上传,别人一看就清楚了。

CCSD优化每一步都会给出T1诊断值,显然取最后一次的
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-3-19 12:58:42 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2020-3-17 20:45
你输入的结构有Cs点群对称性,而乙醇阳离子自由基想来可能没有这个对称性,好像应当是C1。你密度泛函的三个 ...

谢谢您。
我看了下,CCSD的结构确实是有一个虚频。
我将DFT的结构做为初猜给CCSD重新优化,得到的结构与DFT结果基本一致。
但两次CCSD优化得到的能量大致相近:
有虚频的结构能量:-153.797652898
无虚频的结构能量:-153.798108974

如果是这样的话,应该就可以认为DFT的结果是正确了的吧。

谢谢您!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-3-19 13:02:31 | 只看该作者 Only view this author
chemhou 发表于 2020-3-17 21:42
这么简单的一个体系之前应该有很多计算,并且有不少相关的实验光谱数据,可以参照一下
从结构上来说,DFT ...

中性的分子我算了,基本都没有问题。
问题就出在了一价阳离子的结构上,我查了一下,是CCSD优化出来的结构有一个虚频,应该是优化在一个鞍点上...
确实如您所说,DFT的结果更为合理!

感谢您的回复!

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发表于 Post on 2020-3-19 18:24:40 | 只看该作者 Only view this author
Machaophy 发表于 2020-3-19 12:58
谢谢您。
我看了下,CCSD的结构确实是有一个虚频。
我将DFT的结构做为初猜给CCSD重新优化,得到的结构 ...

如果无虚频的结构都类似,应该叫CCSD和DFT在优化这个结构上结果都正确,虚频的结构算是计算操作错误。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-3-19 21:25:56 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-3-18 14:06
你的输入文件里做了振动分析但是你的描述里却没提振动分析,看看都有没有虚频。最好是直接把输出文件都压缩 ...

抱歉Sob老师,我下次一定注意...
我看了CCSD的振动分析,确实有虚频。
我用DFT优化后的结构给CCSD作为初猜,再次优化出来的结构就没有虚频了....

应该DFT 算出来的是对的..

谢谢Sob老师

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-3-20 11:58:36 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2020-3-19 18:24
如果无虚频的结构都类似,应该叫CCSD和DFT在优化这个结构上结果都正确,虚频的结构算是计算操作错误。

嗯嗯,好的
我晓得了,谢谢您!

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