计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 22875|回复 Reply: 16
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Gaussian/gview] 求助高斯NMR自旋耦合常数的计算

[复制链接 Copy URL]

538

帖子

2

威望

2592

eV
积分
3170

Level 5 (御坂)

老师:您好!请问怎样看高斯计算NMR自旋耦合常数的输出文件?或者请问您是否有关于NMR的帖子?我想拜读一下,谢谢!

3097

帖子

29

威望

1万

eV
积分
17221

Level 6 (一方通行)

2#
发表于 Post on 2015-11-20 22:56:34 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 liyuanhe211 于 2015-11-20 22:59 编辑

打开看,J-J coupling constant都以两两原子间列表的形式列在里面。
印象中10.1021/jo501781b这篇文献的SI里似乎直接教你怎么算,给出了输入和输出案例(对输出略有修改,但容易类比理解),但是现在学校的部分IP被ACS临时封了,没法确认,笔记上只留了一个截图,你可以下下来看一下。

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +3 收起 理由
Reason
sobereva + 3

查看全部评分 View all ratings

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125141

管理员

公社社长

3#
发表于 Post on 2015-11-21 01:43:57 | 只看该作者 Only view this author


输出的J矩阵的(i,j)矩阵元就是i,j两个原子间的核自旋-自旋耦合常数。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

538

帖子

2

威望

2592

eV
积分
3170

Level 5 (御坂)

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-11-21 14:13:41 | 只看该作者 Only view this author
谢谢老师!@sobereva @liyuanhe211

538

帖子

2

威望

2592

eV
积分
3170

Level 5 (御坂)

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-11-21 15:28:23 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 风飞 于 2015-11-21 16:31 编辑
风飞 发表于 2015-11-21 14:13
谢谢老师!@sobereva @liyuanhe211


老师:您好!我还有几个疑问:1)您说高斯中默认的N的是N14,那请问B,H, C 的同位素分别是多少呢?2)对于输出文件的耦合常数有很多种,我们是不是只读取费米耦合常数,还是读最后的总的核自旋耦合常数?(要用于和实验做比较)

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125141

管理员

公社社长

6#
发表于 Post on 2015-11-21 21:14:02 | 只看该作者 Only view this author
风飞 发表于 2015-11-21 15:28
老师:您好!我还有几个疑问:1)您说高斯中默认的N的是N14,那请问B,H, C 的同位素分别是多少呢?2) ...

读取总的
同位素是多少当你用了#P的时候输出文件一开始就显示了
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

22

帖子

0

威望

238

eV
积分
260

Level 3 能力者

7#
发表于 Post on 2015-11-22 10:07:26 | 只看该作者 Only view this author
各位老师,2楼第一部分是计算结构,第二部分算NMR,第三部分算J,输入文件最后几行是啥意思,文中说的DU4是啥,我还是看不大明白,可否解释下第三部分?

39

帖子

0

威望

247

eV
积分
286

Level 3 能力者

8#
发表于 Post on 2017-7-14 01:11:07 | 只看该作者 Only view this author
看了sob老师和Dr. Li的回帖,我明白了如何计算耦合常数J,但是还不清楚如何看计算结果,比如 结果中J = 0.341108D+02 这个如何转为实际的数值,谢谢

Q_1.jpg (202.81 KB, 下载次数 Times of downloads: 80)

Q_1.jpg

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125141

管理员

公社社长

9#
发表于 Post on 2017-7-14 10:10:50 | 只看该作者 Only view this author
quora 发表于 2017-7-14 01:11
看了sob老师和Dr. Li的回帖,我明白了如何计算耦合常数J,但是还不清楚如何看计算结果,比如 结果中J = 0.3 ...

0.341108D+02 = 34.1108
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

39

帖子

0

威望

247

eV
积分
286

Level 3 能力者

10#
发表于 Post on 2017-7-14 10:39:16 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-7-14 10:10
0.341108D+02 = 34.1108

谢谢您!但是341108D+02 = 34.1108 ,34HZ的耦合常数太大,是不是还要转换一下才了可以呢?那如何转换啊,谢谢

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125141

管理员

公社社长

11#
发表于 Post on 2017-7-14 10:43:27 | 只看该作者 Only view this author
quora 发表于 2017-7-14 10:39
谢谢您!但是341108D+02 = 34.1108 ,34HZ的耦合常数太大,是不是还要转换一下才了可以呢?那如何转换啊 ...

不需要转换,参考例子

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

39

帖子

0

威望

247

eV
积分
286

Level 3 能力者

12#
发表于 Post on 2017-7-14 10:48:09 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-7-14 10:43
不需要转换,参考例子

谢谢sob老师,明白了

73

帖子

0

威望

144

eV
积分
217

Level 3 能力者

13#
发表于 Post on 2017-8-19 22:43:30 | 只看该作者 Only view this author
请问sob老师,计算耦合常数用什么泛函较好?基组的iglo和pcj序列哪些是高斯内置的?哪些泛函和基组您觉得计算结果还不错?

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125141

管理员

公社社长

14#
发表于 Post on 2017-8-19 23:36:54 | 只看该作者 Only view this author
qcn 发表于 2017-8-19 22:43
请问sob老师,计算耦合常数用什么泛函较好?基组的iglo和pcj序列哪些是高斯内置的?哪些泛函和基组您觉得计 ...

B3LYP就可以。用B97-2或者KT1可能更好些。
推荐pc-J
是否高斯内置的看手册便知。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

73

帖子

0

威望

144

eV
积分
217

Level 3 能力者

15#
发表于 Post on 2017-8-20 10:24:51 | 只看该作者 Only view this author
谢谢Sob老师的回复

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-21 02:41 , Processed in 0.193760 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list