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[GROMACS] 求助 MOFs材料跑分子动力学模拟

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自己根据文献合成的ZIF-8(Zn)MOFs材料,请教一下各位老师,是否能用gromacs进行分子动力学模拟,选用哪个力场比较合适,MOFs材料的分子动力学模拟对于原子电荷有没有要求?
钱塘江上潮信来,今日方知我是我。

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发表于 Post on 2020-6-7 19:44:13 | 只看该作者 Only view this author
可以试试GFN-FF?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-6-7 21:16:50 | 只看该作者 Only view this author

可以在gromacs里面完成吗?
钱塘江上潮信来,今日方知我是我。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-6-7 21:21:17 | 只看该作者 Only view this author

老师,是这个 CHARMM General force field吗?
钱塘江上潮信来,今日方知我是我。

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发表于 Post on 2020-6-7 21:59:34 | 只看该作者 Only view this author
晓滨MD 发表于 2020-6-7 21:21
老师,是这个 CHARMM General force field吗?

应该是新版本xtb里面支持的方法

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发表于 Post on 2020-6-7 22:00:29 | 只看该作者 Only view this author

如果是MOFs和蛋白的相互作用 是不是目前也没有比较好的力场能同时描述啊

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发表于 Post on 2020-6-8 15:55:30 | 只看该作者 Only view this author
晓滨MD 发表于 2020-6-7 21:21
老师,是这个 CHARMM General force field吗?

http://bbs.keinsci.com/thread-17302-1-1.html
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