计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 8882|回复 Reply: 7
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[新手求助] 求助吡咯衍生物断键过程电荷与自旋多重度如何确定

[复制链接 Copy URL]

29

帖子

0

威望

509

eV
积分
538

Level 4 (黑子)

最近再算两个结构时,在确定电荷和自旋多重度时遇到了一些问题,结构如图,左侧是原来带一个正电荷的,经过单电子转移得到一个电子,然后键断裂得到一个吡啶自由基,我想知道中间两个结构的电荷和自旋多重度如何确定?左侧1 2,右侧1 2 吗,我最开始设置了右侧是0 2,但是程序报错说“The combination of multiplicity 2 and    58 electrons is impossible”,我将其改为1 2再次计算,得到了优化后的结构,但是我查看Mulliken spin,发现N上自旋布居为0,如果是N自由基的话应该是1才对吧,现在有些懵,希望大佬们能够指导一下,谢谢

1665

帖子

5

威望

4788

eV
积分
6553

Level 6 (一方通行)

喵星人

2#
发表于 Post on 2020-7-11 11:27:36 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 喵星大佬 于 2020-7-11 11:29 编辑

如果不带电,无论怎么断裂总体特不带电。吡啶鎓本身带一个正电荷,SET后应该不带电,断裂后应该是吡啶和R自由基。不谈自选多重度,你后面两个总电荷都没设对。
再一个就是自旋或者电荷并不会只集中在一个原子上。路易斯结构式里的形式电荷和自由基只是一个表示而已。

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125141

管理员

公社社长

3#
发表于 Post on 2020-7-11 11:32:59 | 只看该作者 Only view this author
如置顶的新社员必读贴和论坛首页的公告栏所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,并反映出帖子具体内容,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题“电荷与自旋多重度的计算”改了,以后务必注意

量化计算设的是整个体系的电荷和自旋多重度,而不是原子或片段的
算完了之后,想了解实际单电子怎么分布,算个原子自旋布居便知:
谈谈自旋密度、自旋布居以及在Multiwfn中的绘制和计算
http://sobereva.com/353http://bbs.keinsci.com/thread-4422-1-1.html

想了解原子带电状态,算原子电荷便知,看《原子电荷计算方法的对比》(http://www.whxb.pku.edu.cn/CN/abstract/abstract27818.shtml)了解相关常识,计算分析例子看Multiwfn手册4.7节

不要盲目拿人为臆测、没有体现实际电子离域特征的Lewis结构说事。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

29

帖子

0

威望

509

eV
积分
538

Level 4 (黑子)

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-7-11 14:39:49 | 只看该作者 Only view this author
喵星大佬 发表于 2020-7-11 11:27
如果不带电,无论怎么断裂总体特不带电。吡啶鎓本身带一个正电荷,SET后应该不带电,断裂后应该是吡啶和R自 ...

有两种过程一种是生成吡啶和R自由基,但R吸电性太强所以生成了R-和吡啶自由基的结构

1665

帖子

5

威望

4788

eV
积分
6553

Level 6 (一方通行)

喵星人

5#
发表于 Post on 2020-7-11 16:47:54 | 只看该作者 Only view this author
一骑星尘 发表于 2020-7-11 14:39
有两种过程一种是生成吡啶和R自由基,但R吸电性太强所以生成了R-和吡啶自由基的结构

那吡啶也应该是自由基阳离子,否则你总电子数都多了一个

29

帖子

0

威望

509

eV
积分
538

Level 4 (黑子)

6#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-7-11 17:14:36 | 只看该作者 Only view this author
喵星大佬 发表于 2020-7-11 16:47
那吡啶也应该是自由基阳离子,否则你总电子数都多了一个

是的,我输入0 2时会报错,但前面那个结构我输入1 2会报错,0 2反而不会
您能简单讲讲怎么区分自由基阳离子和自由基的区别吗?我经常把电荷数搞错。。。

1665

帖子

5

威望

4788

eV
积分
6553

Level 6 (一方通行)

喵星人

7#
发表于 Post on 2020-7-13 14:37:02 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 喵星大佬 于 2020-7-13 15:14 编辑
一骑星尘 发表于 2020-7-11 17:14
是的,我输入0 2时会报错,但前面那个结构我输入1 2会报错,0 2反而不会
您能简单讲讲怎么区分自由基阳 ...

对于这种纯有机小分子,数电荷应该是高中就教过的东西。哪怕用路易斯结构式都不会有什么问题,毕竟数电子不涉及电荷和自旋的分布。
以你这个为例,首先第一步原料吡啶鎓阳离子,带一个正电荷,没有未成对电子,输入应该为1 1。单电子转移获得一个电子之后,有一个未成对电子,但总体电荷会从+1变为0,即第一步产物在计算中应该是自由基而不是自由基阳离子,输入为0 2。下一步裂解为两个产物,如果是吡啶分子和R自由基,即未成对电子给R,则分别输入为0 1和0 2,反之未成对电子给吡啶部分,则吡啶部分多了一个电子,为自由基负离子,输入为-1 2,R部分则必须变为R阳离子,输入为1 1。
无论变为多少个部分,所有的电荷数相加应该和断裂之前相同,即无论是0+0还是-1+1都必须和前一步的0相同,而自旋的情况则稍微复杂,一般来说,对于简单体系,在最小自旋的前提下,在断裂前的结构中尽量把未成对电子配对,剩余的未成对电子只能为1或0,即自旋多重度输入为1或2。而断裂中的每个结构各自同样进行此操作,保证电荷数守恒的情况下一般是没什么问题的。然后我再吐槽一下你这个标题啊。。。。明明是吡啶衍生物,写个吡咯衍生物

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +3 收起 理由
Reason
thanhtam + 3 手把手教了2333

查看全部评分 View all ratings

29

帖子

0

威望

509

eV
积分
538

Level 4 (黑子)

8#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-7-13 15:56:28 | 只看该作者 Only view this author
喵星大佬 发表于 2020-7-13 14:37
对于这种纯有机小分子,数电荷应该是高中就教过的东西。哪怕用路易斯结构式都不会有什么问题,毕竟数电子 ...

好的,谢谢您了

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-21 04:55 , Processed in 0.177665 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list