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[GROMACS] 求助两相热力学(2PT)计算熵、焓。程序步骤上如何实现?

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各位老师好,最近看到有篇文章用2PT方法计算了溶解过程的熵(S)和焓(H),参考的文献如下
10.1021/jp103120q

已经大概明白计算的步骤,但是对于如何从程序上实现还不是很明白。
如何从gromacs的轨迹中计算,需要用到什么工具,大概步骤是怎样的?

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发表于 Post on 2024-11-6 15:32:14 | 只看该作者 Only view this author
不要自己在标题里手写【求助】这种标签,http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html里明确说了。这次给你改了,以后注意
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-11-6 16:10:09 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-11-6 15:32
不要自己在标题里手写【求助】这种标签,http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html里明确说了。这次给 ...

下次一定注意。关于这个问题老师可以指教一下吗?

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发表于 Post on 2025-3-11 16:23:36 | 只看该作者 Only view this author
需要自行写程序计算, atlas实验室有发布cpp版本的代码,但是有bug,轨迹稍大就跑不起来,但结果是没问题的。

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