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[Multiwfn使用咨询] 分析RDG填色图遇到的问题

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老师好,我在学习http://sobereva.com/68帖子时,想用RDG填色图分析一下分子内的相互作用,但是不会去使用和分析

左图(1-1)中间和右图(2-1)中间区域对比,右图就有很明显的红色,可以说明绿色区域是范德华作用吗
请问老师,还可以用这个色卡图来分析吗?

谢谢老师

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发表于 Post on 2020-7-4 15:29:01 | 只看该作者 Only view this author
RDG平面图的色彩刻度体现的是RDG的数值,而sign(lambda2)rho着色的RDG等值面图的色彩体现的是sign(lambda2)rho的数值,完全是两码事,根本没有任何可比性。你平面图里的颜色显然和sign(lambda)2rho的色彩刻度毫无联系。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-7-8 09:12:46 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-7-4 15:29
RDG平面图的色彩刻度体现的是RDG的数值,而sign(lambda2)rho着色的RDG等值面图的色彩体现的是sign(lambda2) ...


老师,那RDG数值可以按照这个来分析吗?两个分子内的不一样 可以认为是化学键的强弱不同导致的吗?也就是在单分子内RDG数值的大小可以认为是化学键的强弱不同?

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发表于 Post on 2020-7-9 07:15:56 | 只看该作者 Only view this author
qianbao 发表于 2020-7-8 09:12
老师,那RDG数值可以按照这个来分析吗?两个分子内的不一样 可以认为是化学键的强弱不同导致的吗?也就 ...

我不知道你想说明什么
RDG和化学键强度毫无直接关系。要用实空间函数分析也是应当用ELF、LOL、价层电子密度、变形密度之类的函数分析,仔细看
Multiwfn支持的分析化学键的方法一览
http://sobereva.com/471http://bbs.keinsci.com/thread-12488-1-1.html
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-7-9 13:14:10 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-7-9 07:15
我不知道你想说明什么
RDG和化学键强度毫无直接关系。要用实空间函数分析也是应当用ELF、LOL、价层电子 ...


老师,我是想根据这两个图形的对比做一下分析,但是我理解的是RDG数值是代表相互作用,这个图可以说明的是相互作用的区域,但是否还有其他意义?

然后根据这个,我也没有会分析。

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发表于 Post on 2020-7-10 05:37:09 | 只看该作者 Only view this author
qianbao 发表于 2020-7-9 13:14
老师,我是想根据这两个图形的对比做一下分析,但是我理解的是RDG数值是代表相互作用,这个图可以说明 ...

RDG只能展现可能存在的相互作用区域,既不能体现相互作用类型,也不能体现相互作用强度
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