如何在VMD中让铁晶体以成键的形式显示

Gengshuai · 发表于 Post on 2020-7-14 20:38:59

本帖最后由 Gengshuai 于 2020-7-15 09:01 编辑

E:\请问在MS动力学模拟之后的体系，在转成.xyz文件后在VMD中打开，底层的金属是Fe（110）如何操作才能使像右图文献里显示的一样铁原子之间有键连接，而不是左图单个的原子显示？

sobereva · 发表于 Post on 2020-7-14 20:52:27

增加个Representation，drawing method用dynamic bonds，恰当设置成键判断阈值。

细节看
谈谈VMD可视化程序的连接关系的判断和设置问题
http://sobereva.com/534（http://bbs.keinsci.com/thread-16396-1-1.html）

Gengshuai · 发表于 Post on 2020-7-15 09:07:34

感谢sobereva老师的解答，已搞定，图片非常完美。

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