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[波函数分析交流] 有何参数可以较好地衡量C=C双键的electron rich程度?

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希望general的考察分子中的多个C=C双键,哪个容易与[Pd]配位并氢化,用什么参数可以衡量一根键的“electron rich”程度?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-9-29 22:17:32 | 只看该作者 Only view this author
Sob老师在群里回答时推荐了如下几个参数:静电势、平均局部离子化能、福井函数等
转过来供参阅

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发表于 Post on 2015-9-29 23:41:12 | 只看该作者 Only view this author
还可以计算C-C键BCP处的电子密度(Multiwfn主功能2),或者在C-C之间模糊重叠空间里面对电子密度或变形密度进行积分(Multiwfn主功能15,选8,然后选1是积分电子密度,-2是积分变形密度)。另外也可以考察Mulliken重叠布居。
上述这些,以及静电势,都是衡量电子丰富程度。平均局部离子化能和福井函数则侧重于反应电子的活性。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-10-5 02:09:32 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-9-29 23:41
还可以计算C-C键BCP处的电子密度(Multiwfn主功能2),或者在C-C之间模糊重叠空间里面对电子密度或变形密度 ...

比较C=C双键的π键富电子程度,为什么可以使用BCP处的电子密度,考虑BCP(3,-1)在键轴上,而Pi电子云在键轴位置是节面。

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发表于 Post on 2015-10-5 03:05:30 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2015-10-5 02:09
比较C=C双键的π键富电子程度,为什么可以使用BCP处的电子密度,考虑BCP(3,-1)在键轴上,而Pi电子云在键 ...

虽然pi在键轴上是截面,但还是会影响BCP位置的密度的,只不过没那么直接。其实我也并不很赞同这种方式考察pi密度,但AIM理论对键的考察就是讨论的BCP的性质,所以有局限性。对模糊空间进行积分明显是更好的方法,把两个原子之间的空间全都考虑进去了,而不只是一个点。
另外也可以试图做ELF函数的拓扑分析,在pi键上会有两个极大点,可以考察这样极大点位置的电子密度(我没看过其它文章有这么考虑的,但我认为比较合理。不过也有个问题就是这个极大点的位置也和密度有关系,可能有的pi特征弱一些,极大点就会向键轴靠近,此时密度可能反倒大了)


还有个很理想的办法是你计算pi键正中间的上方比如1Bohr处的电子密度,这用Multiwfn极为容易算。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-10-5 23:07:11 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 liyuanhe211 于 2015-10-6 01:03 编辑
sobereva 发表于 2015-10-5 03:05
虽然pi在键轴上是截面,但还是会影响BCP位置的密度的,只不过没那么直接。其实我也并不很赞同这种方式考 ...

在某些张力较大的分子里(我们常遇到,如较小的桥环+并环体系),双键不是平面的,如何定义“Pi键上方”?
从 C-C 中点向pi-成键轨道的最大分布方向上计算?
这样来看,考虑到电子密度对取点方法的敏感性,是不是积分方法总比某个单点值感觉上更靠谱一点(比如提到的模糊重叠空间的电子密度积分)

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发表于 Post on 2015-10-6 04:21:22 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2015-10-5 23:07
在某些张力较大的分子里(我们常遇到,如较小的桥环+并环体系),双键不是平面的,如何定义“Pi键上方” ...

即便不是平面,也可以定义“上方”
比如就从键的中点出发,沿着那个曲面对应的球心,朝着垂直于C-C键的方向移动1埃。
相对来说用积分更省事、严格一些
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-10-8 22:15:29 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-10-6 04:21
即便不是平面,也可以定义“上方”
比如就从键的中点出发,沿着那个曲面对应的球心,朝着垂直于C-C键的 ...

明白了。谢谢老师~~

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