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[新手求助] 含过渡金属分子密度泛函计算中广义梯度近似GGA含义及其如何使用

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最近老师让我模拟学习一个含过渡金属的分子体系的密度泛函计算,其中包含Cr-Cr金属-金属间成键键,但是使用很多泛函和基组结构优化的结果都与实验值差距过大,
1.想请教,对于含过渡金属且金属金属间成键的体系,密度泛函计算还需要考虑哪些影响?
2.查阅相关文献,其中 J. Chem. Theory Comput. 2012, 8, 908914,作者在计算V-V键的过程中写到,比较实验和计算的金属-金属距离使用几个局部密度近似(LDA)和广义梯度近似(GGA)泛函表明,使用梯度修正方法计算中性配合物更准确,而使用LDA泛函获得的结构是“过度约束的”。
所以想知道GGA是如何使用及定义的?它对计算我这种分子主要的帮助在于哪方面?
基础较为薄弱,还望各位大佬海涵。感谢

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发表于 Post on 2020-7-29 16:42:29 | 只看该作者 Only view this author
简谈量子化学计算中DFT泛函的选择
http://sobereva.com/272
看这个

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发表于 Post on 2020-7-30 00:25:44 | 只看该作者 Only view this author
LDA、GGA这种概念自行去看基础量化书,诸如levine的quantum chemistry。

如果不想学习原理,只想知道用什么合适,看2L提到的我的博文,以及
谈谈量子化学研究中什么时候用B3LYP泛函优化几何结构是适当的
http://sobereva.com/557http://bbs.keinsci.com/thread-17899-1-1.html

算分子体系没有任何人还用LDA(除了一些搞理论方法的人出于特殊目的)

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-7-30 08:45:49 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-7-30 00:25
LDA、GGA这种概念自行去看基础量化书,诸如levine的quantum chemistry。

如果不想学习原理,只想知道用 ...

感谢sob老师,顺带还想问问老师,对于[Cr2(CO3)4]3-这样一个三价负离子,Cr-Cr金属间成键,我不确定他的自旋多重度,所以计算了S=2.4.6下的能量,对比发现他们能量差距极小,但是键距差别大,这个时候应该判断哪个的自旋度是符合的呢?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-7-30 08:53:09 | 只看该作者 Only view this author
biogon 发表于 2020-7-29 16:42
简谈量子化学计算中DFT泛函的选择
http://sobereva.com/272
看这个

感谢您的回复,这个我有认真看过,把认为合适的泛函都用了,只是最后的计算结果与实验值相差较大,过渡金属间直接成键存在非常强金属金属键合相互作用,所以我在想是不是除了泛函基组,我忽略了其他方面的错误或者影响。

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发表于 Post on 2020-7-30 08:57:32 | 只看该作者 Only view this author
浮游物 发表于 2020-7-30 08:45
感谢sob老师,顺带还想问问老师,对于[Cr2(CO3)4]3-这样一个三价负离子,Cr-Cr金属间成键,我不确定他的 ...

能量差极小是多小?
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-7-30 09:28:11 | 只看该作者 Only view this author
冰释之川 发表于 2020-7-30 08:57
能量差极小是多小?

-1381.16281590,-1381.16594329,-1381.17601625例如这个,能量差算小吗?

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发表于 Post on 2020-7-30 11:17:44 | 只看该作者 Only view this author
浮游物 发表于 2020-7-30 09:28
-1381.16281590,-1381.16594329,-1381.17601625例如这个,能量差算小吗?

如果是Hartree单位的话,差别大得飞起。。。1 hartree = 2625.5 kJ mol⁻1 = 27.21 eV = 627.51kcal mol⁻1
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-7-31 10:06:33 | 只看该作者 Only view this author
冰释之川 发表于 2020-7-30 11:17
如果是Hartree单位的话,差别大得飞起。。。1 hartree = 2625.5 kJ mol⁻1 = 27.21 eV = 627.51kcal ...

嗯嗯,是的。但我这个基本是小数点后第二三位才不同,能量差距换算后似乎也不大

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