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[GROMACS] 求助:如何保证提交Gromacs的任务不会因为远程链接中断而中断

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楼主
本帖最后由 Penson 于 2020-8-12 18:20 编辑

如题,我尝试过使用nohup和&组合加在提交任务指令的首尾,但不能成功运行。请问各位老师有什么脚本会其他可用的指令保证远程链接时可以投任务不因中断链接而停止呢?

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努力挖掘科学的本质

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发表于 Post on 2020-8-12 17:47:23 | 只看该作者 Only view this author
tmux了解一下

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-8-12 17:53:51 | 只看该作者 Only view this author

好的,谢谢!
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发表于 Post on 2020-8-12 17:59:58 | 只看该作者 Only view this author
具体描述“不能成功运行”

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发表于 Post on 2020-8-12 19:34:14 | 只看该作者 Only view this author
screen -S xxx   //创建一个名为xxx的窗口,可以在这个窗口里面运行程序,并且断开连接之后这个窗口依然存在
screen -r xxx  //登录到上面创建的xxx的窗口

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-8-13 00:46:30 | 只看该作者 Only view this author
tiandikuoyuan 发表于 2020-8-12 19:34
screen -S xxx   //创建一个名为xxx的窗口,可以在这个窗口里面运行程序,并且断开连接之后这个窗口依然存 ...

好的,谢谢,我晚点试一下,用了楼上的tmux软件也能实现类似操作
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-8-13 00:47:35 | 只看该作者 Only view this author
hebrewsnabla 发表于 2020-8-12 17:59
具体描述“不能成功运行”

就是用“nohup 提交计算的命令 &”这样的方式提交,会报错说,指令有语法错误
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发表于 Post on 2020-8-13 07:57:53 | 只看该作者 Only view this author
nohup ... &对gmx是可以提交的
没有具体命令行没法说

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发表于 Post on 2020-8-13 08:19:00 | 只看该作者 Only view this author
一直都用nohup  一定是你的问题
由衷的感谢每一位给与过我帮助的人

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发表于 Post on 2020-8-13 10:04:08 | 只看该作者 Only view this author
Penson 发表于 2020-8-13 00:47
就是用“nohup 提交计算的命令 &”这样的方式提交,会报错说,指令有语法错误

说明你操作有误,具体命令截图看看

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-8-13 11:59:25 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-8-13 07:57
nohup ... &对gmx是可以提交的
没有具体命令行没法说

好的,sob老师,我应该是弄建模等指令的时候用nohup才出问题的,我没搞清楚使用方法。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-8-13 12:00:06 | 只看该作者 Only view this author
少年爱吃地三鲜 发表于 2020-8-13 08:19
一直都用nohup  一定是你的问题

用nohup投gmx指令的任务确实可以,多谢
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-8-13 12:00:58 | 只看该作者 Only view this author
thanhtam 发表于 2020-8-13 10:04
说明你操作有误,具体命令截图看看

我刚试了用nohup做gmx指令的任务,确实没有问题,谢谢了!
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