计算腐殖酸静电势时使用iso命令报错，不显示分子结构周围的静电势分布

yulongzhanshen · 发表于 Post on 2022-3-19 16:28:07

参考的是http://sobereva.com/443这篇博文，其中pt和ext命令都能得到和博文中一样的效果图，当使用iso命令时，VMD显示窗口不显示静电势分布，命令输入窗口提示如下图

Yan_njit · 发表于 Post on 2022-3-20 12:02:05

本帖最后由 Yan_njit 于 2022-3-20 12:36 编辑

感觉是你的VMD安装不完整导致，可以检查一下VMD的版本号，确保与教程中的一致，另外也可以检查一下作图的文件是否计算完整

yulongzhanshen · 发表于 Post on 2022-3-20 15:35:10

谢谢，我再仔细检查一遍安装和文件

sobereva · 发表于 Post on 2022-3-20 18:23:41

提问时候说清楚VMD版本号
目前一定要用VMD 1.9.3

yulongzhanshen · 发表于 Post on 2022-3-20 21:01:25

谢谢sob老师，问题解决了，是计算完pt.bat和iso.bat后在再打开VMD并输入iso就出现教程中的图片了。我之前是计算完pt.bat就在VMD中输入pt，并没有关闭VMD，然后计算完iso.bat，再在VMD中输入iso就出现描述的问题了。再次感谢sob老师的教程，一定要一字一句看。

supc · 发表于 Post on 2022-3-25 12:03:25

老师您好，静电势图本身红蓝色，除了刻度以外还有其他别的含义嘛

sobereva · 发表于 Post on 2022-4-12 01:42:45

supc 发表于 2022-3-25 12:03
老师您好，静电势图本身红蓝色，除了刻度以外还有其他别的含义嘛

我不理解你的意思
有了色彩刻度条，读者就能根据颜色判断分子表面上不同位置静电势数值是多大，没什么歧义

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