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[Gaussian/gview] Gaussian可以用来研究受限空间内的粒子分布吗?

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楼主
大致上是研究孔道内离子的分布情况,用MC应该可以做,如果用DFT呢?预设不同的分布情况然后计算能量进行取舍可以吗?

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发表于 Post on 2020-9-28 21:35:20 | 只看该作者 Only view this author
直观的做法是绘制静电势等值面图预测靠静电作用导致的分布的优先位置:
绘制静电势全局极小点+等值面图展现孤对电子位置的方法
http://sobereva.com/493http://bbs.keinsci.com/thread-13638-1-1.html

顺带一提,对于范德华作用主导相互作用的情况,可以用范德华势
谈谈范德华势以及在Multiwfn中的计算、分析和绘制
http://sobereva.com/551http://bbs.keinsci.com/thread-17271-1-1.html

量化计算的话,可以做优化,看看有哪些极小点结构、结合能各是多大,判断离子优先出现在哪里
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-9-29 09:34:02 | 只看该作者 Only view this author
谢谢老师,我试一试
不过研究的孔径跟德拜半径在一个数量级,溶质粒子之间的相互作用应该会很明显,如果以外部势场来预测不知道偏差会不会很大?

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发表于 Post on 2020-9-29 11:11:17 | 只看该作者 Only view this author
cheviax 发表于 2020-9-29 09:34
谢谢老师,我试一试
不过研究的孔径跟德拜半径在一个数量级,溶质粒子之间的相互作用应该会很明显,如果以 ...

会很大,为啥不用MC MD呢

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发表于 Post on 2020-9-29 11:41:27 | 只看该作者 Only view this author
cheviax 发表于 2020-9-29 09:34
谢谢老师,我试一试
不过研究的孔径跟德拜半径在一个数量级,溶质粒子之间的相互作用应该会很明显,如果以 ...

如果你要研究的情况出现溶质之间的相互作用,肯定会有偏差,但至少对于讨论溶质与孔道的相互作用是有帮助的
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-9-29 14:10:59 | 只看该作者 Only view this author
bobosiji 发表于 2020-9-29 11:11
会很大,为啥不用MC MD呢

我打算用MC做,不过老师的意思是用DFT

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-9-29 14:12:02 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-9-29 11:41
如果你要研究的情况出现溶质之间的相互作用,肯定会有偏差,但至少对于讨论溶质与孔道的相互作用是有帮助 ...

嗯,先看看孔道的作用也行

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