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[VMD] 求助统计特定距离内分子数目随模拟时间的变化的脚本

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楼主
老师好,我想用VMD统计一下石墨烯(MOL)周围5.0埃内污染物(H)的数目随模拟时间的变化,写了一个脚本,但结果不太对。这个脚本输出结果和帧数不一致,而且我一共就50个污染物分子,结果都输出八百多这个数据。脚本如下:
set numFrame [molinfo top get numframes]
set out [open ry.txt w ]
for {set i 0} {$i < $numFrame} {incr i} {
set hnumber [atomselect top "same resid as (resname H and within 5.0 of resname MOL)"]
$hnumber frame $i
$hnumber update
set a [$hnumber num]
puts $out $a
}   
close $out

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