在做REMD的时候又遇到困惑，想请教以下的图是怎么出来的，谢谢了

xxj9618 · 发表于 Post on 2015-11-3 20:34:59

Figure 1 shows the distribution of the potential energy per atom for all of the replicas. 想请教，这个在gromacs里是怎么做到的，谢谢大家

sobereva · 发表于 Post on 2015-11-3 21:41:02

这应当是WHAM计算，和REMD不是一码事。

xxj9618 · 发表于 Post on 2015-11-9 16:58:19

sobereva 发表于 2015-11-3 21:41
这应当是WHAM计算，和REMD不是一码事。

谢谢sob老师，我自己钻研了下，用g_energy选择potential后，用origin做了频数分析，得到了类似的图

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[GROMACS] 在做REMD的时候又遇到困惑，想请教以下的图是怎么出来的，谢谢了