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[配置讨论] 请各位看一下这个目前配置和报价合理吗?

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本帖最后由 1798224134 于 2023-3-21 01:04 编辑

主要用的软件就是Gaussian,因为最近需要算里德堡态势能面扫描这类的,比较需要算力。 我们课题组目前都是在用Gaussian,有做过渡态和里德堡态的,之后可能会做分子动力学模拟,可能会用到GPU加速。这是我在tb上找的一个商家,然后给他报的双路7763,他给我的配置和报价。想请教各位老师这个可以吗,如果主要用Gaussion的话,预算大概在4到5万,还请各位老师给点意见,感谢。附:计算体系为几十个原子的有机小分子的激发态,比如想用CCSD(t)/d-Aug-cc-pVTZ 算出一些有机小分子的里德堡态势能面,精度要求到几个mEV,这个配置能实现吗?

CPU: AMD 7763 2.45G 64核128线程 13000*2
散热器: 猫头鹰4189 U12S  750*2
主板: 超威H12DSI 4500(是否可换技嘉的MZ72-HB0)
内存: SK 32G ecc 3200  450*16(是否可换三星的)
ssd: 三星980PRO 2TB 1250 (是否换9a1)
机械:硬盘西数16TB企业级 1550
机箱:追风者620 880
电源:振华2000W 3480


总价: 45000



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发表于 Post on 2023-3-21 02:42:03 | 只看该作者 Only view this author
没有叫Gaussion的程序
建议用PM9A1
MZ72-HB0完全可以
可以三星的
先估计好GPU用什么,电源没必要那么浪费
7763性价比太低。7B13划算多了
猫头鹰的4189的是给XEON用的,你的U应当用NH-U12S TR4-SP3
CCSD(T)没法算里德堡激发,几十原子根本算不动
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-3-21 14:22:18 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-3-21 02:42
没有叫Gaussion的程序
建议用PM9A1
MZ72-HB0完全可以

感谢卢老师的回复,您的建议对我们的帮助很大。
还想再请教一下老师:
因为这台服务器买来,我们课题组估计会用很久(至少七八年),所以考虑7b13的主频(2.25)比7763(2.45)低一些,加上我了解到的Gaussian在多核并行效率会随着核数的上升而下降,所以我感觉主频高一点会好一些,而且这台设配也会用上好几年;
还有一个问题就是关于Gaussian的GPU加速这块,是所有的Gaussian16版本都支持吗?以及一块4090对Gaussian的加速影响有多大,如果有不错的提升的话,我们也会考虑;
我们目前的主要用的软件就是Gausssian,但之后也会考虑用其他量化软件和分子动力学软件(如ORCA、Molpro以及GROMACS),这套配置运行其他的量化软件有啥大问题吗?
还请卢老师给点建议,非常感谢卢老师!

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发表于 Post on 2023-3-21 14:51:51 | 只看该作者 Only view this author
1798224134 发表于 2023-3-21 14:22
感谢卢老师的回复,您的建议对我们的帮助很大。
还想再请教一下老师:
因为这台服务器买来,我们课题组 ...

7B13 基础频率比较低,不过全核心睿频并不低。我自己用7B13满载128核心时候 频率维持在3.2-3.3GHz之间. 温度77度。 论坛上各个帖子里的测试也跑过,跟7763,7T83这种 并没有什么很大差异。毕竟都是280W功率的

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发表于 Post on 2023-3-21 15:10:04 | 只看该作者 Only view this author
高斯只能使用具有双精度性能的专业卡。
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发表于 Post on 2023-3-21 16:02:24 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 Entropy.S.I 于 2023-3-21 16:05 编辑
1798224134 发表于 2023-3-21 14:22
感谢卢老师的回复,您的建议对我们的帮助很大。
还想再请教一下老师:
因为这台服务器买来,我们课题组 ...

都什么年代还在看base clock??

http://bbs.keinsci.com/thread-35744-1-1.html  6楼
http://bbs.keinsci.com/thread-35343-1-1.html  4楼

现在各种boost机制满天飞,还看base clock,大清亡了你都浑然不知。尤其是对于高性能计算用途,芯片厂商自己都在大力宣传boost而不提base clock
- 向着虚无前进 -

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发表于 Post on 2023-3-21 23:48:23 | 只看该作者 Only view this author
1798224134 发表于 2023-3-21 14:22
感谢卢老师的回复,您的建议对我们的帮助很大。
还想再请教一下老师:
因为这台服务器买来,我们课题组 ...

Gaussian的GPU加速基本就是摆设,甚至连鸡肋都谈不上。手头恰好有Tesla可以用,但买机子时刻意试图考虑用Gaussian的GPU加速则毫无意义
此配置适合任何主流的靠CPU计算的量子化学和第一性原理程序。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-3-22 14:43:05 | 只看该作者 Only view this author
paramecium86 发表于 2023-3-21 14:51
7B13 基础频率比较低,不过全核心睿频并不低。我自己用7B13满载128核心时候 频率维持在3.2-3.3GHz之间.  ...

好的,了解到了,谢谢!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-3-22 14:44:11 | 只看该作者 Only view this author
Entropy.S.I 发表于 2023-3-21 16:02
都什么年代还在看base clock??

http://bbs.keinsci.com/thread-35744-1-1.html  6楼

好的,谢谢老师!明白您的意思了。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-3-22 14:45:38 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-3-21 23:48
Gaussian的GPU加速基本就是摆设,甚至连鸡肋都谈不上。手头恰好有Tesla可以用,但买机子时刻意试图考虑用 ...

好的,明白了,感谢卢老师的建议!

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