求溶质在溶剂环境下的自由能时得不到气象下的构型

最瘦二师兄 · 发表于 Post on 2021-1-22 15:39:11

各位大神大家好，我根据sob老师的帖子http://sobereva.com/327计算溶质在溶剂环境下的自由能（ = 溶质在1atm气相下的自由能 + 直接通过隐式溶剂模型计算的溶解自由能（始末都是1M） + 1.89kcal/mol）。但我无论如何得不到气象下的稳定构型（隐形模型下得到了稳定构型，但我的体系不是中性的，是-1价的，所以我猜测我的构型气象和溶剂模型下应该不完全一样）。这种情况下，我该怎么计算溶质的总自由能呢？此外，我是计算反应的deltaG，该反应的涉及到的其他物质我都用上述方法得到了其G，现在只差该物质的了。如果真的用其他方法得到该物质的G，逻辑上是否可行？提前谢谢大家！

喵星大佬 · 发表于 Post on 2021-1-22 17:19:39

你可以选择从头到尾都直接用隐式溶剂模型下的构型，热力学校正量和电子能量。

sobereva · 发表于 Post on 2021-1-22 17:54:53

溶剂模型下做opt freq得到自由能热校正量，并用这个结构算气象高精度单点和溶解自由能，三者相加再加1.89

最瘦二师兄 · 发表于 Post on 2021-1-23 18:10:37

喵星大佬发表于 2021-1-22 17:19
你可以选择从头到尾都直接用隐式溶剂模型下的构型，热力学校正量和电子能量。

好的，谢谢

最瘦二师兄 · 发表于 Post on 2021-1-23 18:11:09

sobereva 发表于 2021-1-22 17:54
溶剂模型下做opt freq得到自由能热校正量，并用这个结构算气象高精度单点和溶解自由能，三者相加再加1.89

好的，谢谢sob老师

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