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[Lammps] 如何用命令方式提取lammps输出的数据?

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如何用in文件命令方式提取thermo_style   custom step cpu  v_n_mid_h  v_n_mid_o  ebond  eangle输出信息中的第三四列数据到一个单独的文件中?

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发表于 Post on 2021-4-21 17:34:32 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 lyj714 于 2021-4-21 17:35 编辑

找到你需要的关键词,先grep行,再awk输出列,比如
  1. grep "E_angle" lammps.log |awk '{print $NF}'
复制代码
即找到lammps.log文件中的关键字E_angle所有行,然后输出最后一列数据。依葫芦画瓢即可。自己学点shell语言就懂了

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发表于 Post on 2021-4-21 17:43:35 | 只看该作者 Only view this author
如置顶的新社员必读贴和论坛首页的公告栏所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,并反映出帖子具体内容,避免有任何歧义,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题“lammps数据提取”改了,以后务必注意。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-4-21 18:28:37 | 只看该作者 Only view this author
lyj714 发表于 2021-4-21 17:34
找到你需要的关键词,先grep行,再awk输出列,比如即找到lammps.log文件中的关键字E_angle所有行,然后输出 ...

大佬,请问直接在thermo_style那行命令中加grep吗?还是grep要单独一行,还有{print $NF}中的N代表什么意思呀?非常感谢!!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-4-21 18:35:30 | 只看该作者 Only view this author
Merry 发表于 2021-4-21 18:28
大佬,请问直接在thermo_style那行命令中加grep吗?还是grep要单独一行,还有{print $NF}中的N代表什么意 ...

直接在in文件中写入grep吗?
C:\Users\admin\Pictures\Camera Roll

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-4-21 18:38:26 | 只看该作者 Only view this author
Merry 发表于 2021-4-21 18:35
直接在in文件中写入grep吗?

想通过in文件命令直接生成

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发表于 Post on 2021-4-21 19:27:29 | 只看该作者 Only view this author
Merry 发表于 2021-4-21 18:38
想通过in文件命令直接生成

前面都有人给你写出思路了,去b站找视频入门一下linux然后看看grep和awk的教程两三个小时就能学会,对日后帮助也很大,做模拟多少都得会点shell脚本,也算是必备技能了
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-4-21 19:34:25 | 只看该作者 Only view this author
Lacrimosa 发表于 2021-4-21 19:27
前面都有人给你写出思路了,去b站找视频入门一下linux然后看看grep和awk的教程两三个小时就能学会,对日 ...

好的好的,感谢大佬指路

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