求助:amber的radial如何实现两个分子之间的径向分布计算

任嘉人amber

各位老师好，体系是A和B两个有机分子，跑完动力学后，想做rdf，看A周围B的分布情况，amber的radial只是对某两个具体原子之间进行rdf的计算，请问各位老师如果是计算两个分子之间的径向分布函数应该怎么办呢？

蕊蕊花儿杰杰

您好，我也是搞的两个小分子，请问我现在用amber分别作了小分子A、B的参数，我该怎么让两个A、两个B一起跑动力学呢？然后跑完看A周围B的变化，请问您这个问题解决了吗？谢谢。