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[综合交流] 烯醇互变异构过渡态的寻找

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本帖最后由 ct_2015 于 2015-10-21 10:36 编辑

RT,结构如图。本人使用ts和qst2方法寻找到了可疑过渡态,但是经过IRC计算验证连接的起始物和产物不正确,请高手帮忙解答下,跪谢!

2ts3.png (17.12 KB, 下载次数 Times of downloads: 73)

互变反应式

互变反应式

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发表于 Post on 2015-10-21 13:19:26 | 只看该作者 Only view this author
把现在算出来的过渡态提供一下(-_-)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-10-21 14:29:12 | 只看该作者 Only view this author
计算过渡态的输出文件,谢谢!@liyuanhe211

2ts3_new_qst2.log

1.68 MB, 下载次数 Times of downloads: 60

计算的过渡态的输出文件

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-10-21 14:43:12 | 只看该作者 Only view this author
这是TS方法计算的结果,谢谢!@liyuanhe211

2ts3C.log

4.64 MB, 下载次数 Times of downloads: 13306

TS法过渡态输出文件

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发表于 Post on 2015-10-21 18:24:13 | 只看该作者 Only view this author
把TS和QST2产生的TS下做的IRC的输出文件都贴上来。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-10-22 10:26:59 | 只看该作者 Only view this author
TS产生的TS做的IRC的输出文件@sobereva

f2ts3C.log

2.52 MB, 下载次数 Times of downloads: 25

r2ts3C.log

3.32 MB, 下载次数 Times of downloads: 26

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-10-22 10:34:34 | 只看该作者 Only view this author
不好意识,分子结构好像画错了,其杂五元环的氧原子应该是氮原子@sobereva @liyuanhe211

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-10-22 10:36:14 | 只看该作者 Only view this author
QST2产生的TS做的IRC的输出文件今天已不能上传了,太大了,明天再传@sobereva

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发表于 Post on 2015-10-22 12:57:58 | 只看该作者 Only view this author
ct_2015 发表于 2015-10-22 10:36
QST2产生的TS做的IRC的输出文件今天已不能上传了,太大了,明天再传@sobereva


传之前先压缩啊,这样别人下载快,还省论坛空间。或者传网盘也行。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-10-22 14:02:39 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-10-22 12:57
传之前先压缩啊,这样别人下载快,还省论坛空间。或者传网盘也行。

对啦,没想到这个

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-10-22 14:08:47 | 只看该作者 Only view this author
http://pan.baidu.com/s/1eQDFHHS QST2法得TS后IRC计算后的输出文件,在网盘,麻烦Sob老师自己下载,谢谢!
@sobereva

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发表于 Post on 2015-10-22 17:16:53 | 只看该作者 Only view this author
我看了,很正常嘛。整个迁移是两步过程,先从C8迁移到C9,再迁移到O14。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-10-22 19:45:41 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-10-22 17:16
我看了,很正常嘛。整个迁移是两步过程,先从C8迁移到C9,再迁移到O14。

那Sob老师的意思是这个异构化反应是两步反应么,中间还有个中间产物?@sobereva

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发表于 Post on 2015-10-22 22:14:37 | 只看该作者 Only view this author
ct_2015 发表于 2015-10-22 19:45
那Sob老师的意思是这个异构化反应是两步反应么,中间还有个中间产物?@sobereva

yes
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-10-23 09:19:54 | 只看该作者 Only view this author

thank you very much!

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