捐赠本论坛 (Donate this site)
开启辅助访问 切换到宽版

计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
计算化学公社»论坛首页 › 理论与计算化学 (Theoretical and Computational Chemistry) › 分子模拟 (Molecular Modeling) › Gromacs模拟蛋白配体复合物体系做SMD时出现报错中断问题
返回列表 Return 发新帖
Views: 657|回复 Reply: 0
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[GROMACS] Gromacs模拟蛋白配体复合物体系做SMD时出现报错中断问题

[复制链接 Copy URL]
m韩梅梅

2

帖子

0

威望

95

eV
积分
97

Level 2 能力者
跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
发表于 Post on 2023-7-27 15:56:15 | 只看该作者 Only view this author |只看大图 View big picture 回帖奖励 |倒序浏览 Reverse view |阅读模式 Reading model
在做模拟过程中，出现了报错说距离超过盒长的一半，按照提示，在mdp文件里的pull参数部分的“pull_geometry = direction”改为“pull-geometry = direction-periodic”之后，仍然会在同样的地方再次报错中断，报错内容一样，请问这种情况改如何解决？

202307271550268711..png (17.31 KB, 下载次数 Times of downloads: 12)

202307271550268711..png
回复 Reply

举报 Report

返回列表 Return 发新帖

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-1-24 15:49 , Processed in 2.219285 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list