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[GROMACS] 怎么用平衡模拟方法计算体系的粘度啊

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周期微扰法做出的粘度结果和你施加的cos-accelation值关系太密切了,这样的话对于一个体系来说就没有一个能够在很广的温度范围内普遍适用的cos-accelation值,经常会出现这个温度下使用一个cos-accelation值得到和实验点接近的粘度结果,但是换一个温度之后这个cos-accelation值得出的粘度结果就不准了,所以我想用平衡方法来做避免这个参数带来的影响,请问哪里有教程吗?

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发表于 Post on 2021-4-7 15:01:04 | 只看该作者 Only view this author
平衡方法 似乎也很难算准

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发表于 Post on 2021-4-7 17:15:42 | 只看该作者 Only view this author
力场本来就不是温度普适的,不是NEMD方法的问题。

以及你在同个温度下用不同的cos-accelation得到不同viscosity的时候,就没有感到担心吗?

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发表于 Post on 2021-4-8 03:08:31 | 只看该作者 Only view this author
同一个问题别在两处问,下次发现直接删帖+记违规
http://bbs.keinsci.com/forum.php ... 52459&fromuid=1
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