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[GROMACS] 求助粗粒化模拟下,rvdw_switch的使用

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Level 3 能力者

本人研究膜蛋白的相互作用,在早期的一个模拟中,没有设置rvdw_switch,系统默认为0,但是,现在粗粒化大部分模拟设置的参数为rvdw_switch=0.9,一般现在普遍设的范围rvdw_switch~rvdw=0.9-1.2,但现在为0-1.2,这样的情况是否会对模拟产生致命的影响,谢谢各位老师指导!

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Level 5 (御坂)

2#
发表于 Post on 2021-5-12 15:37:34 | 只看该作者 Only view this author
你用的是Martini吗?我记得Martini用的是shift,不是switch。

不是Martini就算了。

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