计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 11219|回复 Reply: 1
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[GROMACS] 求助粗粒化模拟下,rvdw_switch的使用

[复制链接 Copy URL]

15

帖子

0

威望

139

eV
积分
154

Level 3 能力者

本人研究膜蛋白的相互作用,在早期的一个模拟中,没有设置rvdw_switch,系统默认为0,但是,现在粗粒化大部分模拟设置的参数为rvdw_switch=0.9,一般现在普遍设的范围rvdw_switch~rvdw=0.9-1.2,但现在为0-1.2,这样的情况是否会对模拟产生致命的影响,谢谢各位老师指导!

561

帖子

0

威望

3410

eV
积分
3971

Level 5 (御坂)

2#
发表于 Post on 2021-5-12 15:37:34 | 只看该作者 Only view this author
你用的是Martini吗?我记得Martini用的是shift,不是switch。

不是Martini就算了。

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-23 01:21 , Processed in 0.217488 second(s), 20 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list