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[综合交流] 求助:用GaussianView打开Chem3D绘制的结构图显示出的结构与原结构不符

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各位大佬们好。
我用Chem3D画的结构图另存为.mol格式和.gjf格式后再用GaussianView打开后发现GaussianView中显示的结构和我在Chem3D中画出来的不同,然后我在一个QQ群里问了下,有大佬说这是因为高斯有时候判断成键不准确,但是我想把这个修改正确,或者是想找找有什么办法可以让高斯中显示的和Chem3D中的相同,请各位大佬们帮帮我。
谢谢了。

化合物的化学结构




Chem3D绘制的结构


用GaussianView打开后的结构(黄色框出的部分是用Gaussian打开后错误的部分,另外Gaussian中心苯环上的双键也有问题)


群大佬的解惑。

请各位大佬帮忙解惑,谢谢了!

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发表于 Post on 2021-3-18 21:36:49 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 liyuanhe211 于 2021-3-18 21:38 编辑

分子立场优化一下会好很多,你这键长差的也太远了。虽然可以手动一根一根的改,然而人家都告诉你了没有影响你改它干嘛

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发表于 Post on 2021-3-19 06:54:22 | 只看该作者 Only view this author
别瞎拼写GaussView

仔细看此文
谈谈原子间是否成键的判断问题
http://sobereva.com/414http://bbs.keinsci.com/thread-9840-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-3-19 14:00:21 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-3-19 06:54
别瞎拼写GaussView

仔细看此文

好的,谢谢大佬了 ,下次会写正确的

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发表于 Post on 2021-5-13 19:44:23 | 只看该作者 Only view this author
可以邀请我进这个群吗?想学chem3D

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发表于 Post on 2021-5-13 22:11:02 | 只看该作者 Only view this author
嘤嘤嘤 发表于 2021-5-13 19:44
可以邀请我进这个群吗?想学chem3D

Chem3D都是点鼠标的活儿,哪里会有群专门去学Chem3D的。。。
自动做多参考态计算的程序MOKIT

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