求助：使用grompp命令时出现如下报错应该如何解决？

dumsky2019928 · 发表于 Post on 2021-5-15 22:20:39

ERROR: The cut-off length is longer than half the shortest box vector or longer than the smallest box diagonal element. Increase the box size or decrease rlist.

我用的盒子尺寸为7.5nm*7.5nm*7.5nm，gromacs的版本是2018.8，所有的输入文件均上传于附件之中。

sobereva · 发表于 Post on 2021-5-17 02:52:06

ea.itp和no3.itp根本都不规矩，连残基名都没有
no3.itp里都没二面角项，根本没法用，平面都维持不了

dumsky2019928 · 发表于 Post on 2021-5-19 04:03:51

sobereva 发表于 2021-5-17 02:52
ea.itp和no3.itp根本都不规矩，连残基名都没有
no3.itp里都没二面角项，根本没法用，平面都维持不了

谢谢老师！

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[GROMACS] 求助：使用grompp命令时出现如下报错应该如何解决？

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