计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 6124|回复 Reply: 4
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Linux] slurm调度并行计算集群搭建实录

[复制链接 Copy URL]

2301

帖子

1

威望

5473

eV
积分
7794

Level 6 (一方通行)

本帖最后由 abin 于 2021-5-9 15:54 编辑

视频实录。

通过虚拟机演示,
从centOS8最小安装开始,
逐步调试为适用于计算化学的并行计算集群。
部分打字输入过程有剪辑;部分yum install环节有加速。

视频内容涵盖,适用于计算化学之用的服务器的安装,存储设定,NFS设定,NIS设定,slurm源码编译以及配置。
所有技术流程均来自于各解决方案的官方手册。
视频仅供参考。



视频链接
https://b23.tv/jIF9Kh




评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +3 收起 理由
Reason
Butadiene + 3

查看全部评分 View all ratings

High-Performance Computing for You
为您专属定制的高性能计算解决方案

更多讯息,请访问:
https://labitc.top
http://tophpc.top:8080
电邮: ask@hpc4you.top

538

帖子

2

威望

2476

eV
积分
3054

Level 5 (御坂)

2#
发表于 Post on 2021-6-6 22:49:33 | 只看该作者 Only view this author
老师,您好,我的系统是centos 7.8 ,由于升级了gcc (从4.8.5 升级到8.3.0 ,以致于我的之前的torque PBS在提交任务时出现问题,现在拟装slurm ,看到了您帖子,请问按照您的步骤安装,合适吗?

2301

帖子

1

威望

5473

eV
积分
7794

Level 6 (一方通行)

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-6-7 09:31:20 | 只看该作者 Only view this author
风飞 发表于 2021-6-6 22:49
老师,您好,我的系统是centos 7.8 ,由于升级了gcc (从4.8.5 升级到8.3.0 ,以致于我的之前的torque PBS在 ...

撤销你自己安装的GCC即可。

如果实在想手动安装GCC高版本,
可以参考:
GCC9源码编译
https://www.bilibili.com/video/BV1HJ411H7Ca
视频中的技术方案,适用于绕开root授权,给自己安装软件的场景。

或者使用这个方案获取高版本工具:
https://www.softwarecollections.org/en/

从PBS系列,切换到slurm,需要先清空之前的队列设定。

更多解决方案, 可以查阅https://gitee.com/hpc4you/linux 自行了解。

祝好。
High-Performance Computing for You
为您专属定制的高性能计算解决方案

更多讯息,请访问:
https://labitc.top
http://tophpc.top:8080
电邮: ask@hpc4you.top

538

帖子

2

威望

2476

eV
积分
3054

Level 5 (御坂)

4#
发表于 Post on 2021-6-7 12:27:20 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 风飞 于 2021-6-7 12:39 编辑
abin 发表于 2021-6-7 09:31
撤销你自己安装的GCC即可。

如果实在想手动安装GCC高版本,

我升级gcc是为了安装cp2k. 请问按照你说的哪种方法安装gcc可以呢?

2301

帖子

1

威望

5473

eV
积分
7794

Level 6 (一方通行)

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-6-7 13:42:06 | 只看该作者 Only view this author
风飞 发表于 2021-6-7 12:27
我升级gcc是为了安装cp2k. 请问按照你说的哪种方法安装gcc可以呢?

如果实在想手动安装GCC高版本,
可以参考:
GCC9源码编译
https://www.bilibili.com/video/BV1HJ411H7Ca
视频中的技术方案,适用于绕开root授权,给自己安装软件的场景。

或者使用这个方案获取高版本工具:
https://www.softwarecollections.org/en/

-------
以上内容,请仔细阅读。

另,我有针对intel处理器优化编译的cp2k,支持AVX512指令集,有需要可以联系我。
High-Performance Computing for You
为您专属定制的高性能计算解决方案

更多讯息,请访问:
https://labitc.top
http://tophpc.top:8080
电邮: ask@hpc4you.top

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-24 00:47 , Processed in 0.173155 second(s), 22 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list