计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 15050|回复 Reply: 8
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[综合交流] 请问高斯计算有机反应,金属离子盐如何处理

[复制链接 Copy URL]

65

帖子

0

威望

397

eV
积分
462

Level 3 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
请问,一些有机反应涉及到离子化合物,例如一些金属类路易斯酸盐,再例如成钠盐,那是直接用带负电离子作为反应物,还是要金属也加在反应计算中,很疑惑

1665

帖子

5

威望

4788

eV
积分
6553

Level 6 (一方通行)

喵星人

2#
发表于 Post on 2021-5-13 18:34:17 | 只看该作者 Only view this author
看溶剂,极性溶剂可以认为是离子,非极性溶剂就要好好考虑了

39

帖子

0

威望

777

eV
积分
816

Level 4 (黑子)

3#
发表于 Post on 2021-5-24 13:27:08 | 只看该作者 Only view this author
喵星大佬 发表于 2021-5-13 18:34
看溶剂,极性溶剂可以认为是离子,非极性溶剂就要好好考虑了

您好,我也遇到了这样的问题,我想请问非极性溶剂要如何考虑呢?需要两种情况都计算一下吗?

1万

帖子

0

威望

9855

eV
积分
22090

Level 6 (一方通行)

4#
发表于 Post on 2021-5-24 17:33:10 | 只看该作者 Only view this author
WMQueen 发表于 2021-5-24 06:27
您好,我也遇到了这样的问题,我想请问非极性溶剂要如何考虑呢?需要两种情况都计算一下吗?

把抗衡离子放在你要算的体系旁边比较远的位置。如果你要算的体系里有可以与金属离子配位的原子,可以把金属离子放在那些原子附近。然后做结构优化
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

39

帖子

0

威望

777

eV
积分
816

Level 4 (黑子)

5#
发表于 Post on 2021-5-24 20:41:13 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-5-24 17:33
把抗衡离子放在你要算的体系旁边比较远的位置。如果你要算的体系里有可以与金属离子配位的原子,可以把金 ...

不好意思我不太理解,请问是这样吗:金属离子和阴离子须同时考虑,但并不一定放在一起?那势能零点还是取电离后的两部分吗?为什么不是直接用整个分子计算呢?

1万

帖子

0

威望

9855

eV
积分
22090

Level 6 (一方通行)

6#
发表于 Post on 2021-5-24 22:56:26 | 只看该作者 Only view this author
WMQueen 发表于 2021-5-24 13:41
不好意思我不太理解,请问是这样吗:金属离子和阴离子须同时考虑,但并不一定放在一起?那势能零点还是取 ...

我的意思是要放在一起算,但是初始结构里面阴阳离子放得远一些。势能零点按在一起算
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

39

帖子

0

威望

777

eV
积分
816

Level 4 (黑子)

7#
发表于 Post on 2021-6-22 21:06:51 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-5-24 22:56
我的意思是要放在一起算,但是初始结构里面阴阳离子放得远一些。势能零点按在一起算

您好,不好意思打扰了,这个问题我还想再追问一下,请问初始结构里面必须要将阴阳离子放得远一些吗,因为我算的体系当中,阳离子和反应物配位虽能抵消一部分盐电离的能量,但能量还是会上升十几千卡,导致后续的过渡态能量比较高,这种情况阴阳离子是不是不应该分开呀?

1万

帖子

0

威望

9855

eV
积分
22090

Level 6 (一方通行)

8#
发表于 Post on 2021-6-22 22:59:33 | 只看该作者 Only view this author
WMQueen 发表于 2021-6-22 14:06
您好,不好意思打扰了,这个问题我还想再追问一下,请问初始结构里面必须要将阴阳离子放得远一些吗,因为 ...

我的意思是,结构优化的初猜结构放得远一些,结构优化过程中两者会自动靠近。
之所以初猜结构要放得远一些,是因为有时候阴阳离子有两种结合模式,一种是非共价结合,离得远,另一种是共价结合,离得近,类似物理吸附与化学吸附的关系。只有初始结构两个离子放得足够远,才能保证找到前者。如果放得太近,比非共价结合的结构还要近,那有可能优化到共价结合的结构,结果就不是你想要的了。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

39

帖子

0

威望

777

eV
积分
816

Level 4 (黑子)

9#
发表于 Post on 2021-6-23 11:47:58 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-6-22 22:59
我的意思是,结构优化的初猜结构放得远一些,结构优化过程中两者会自动靠近。
之所以初猜结构要放得远一 ...

谢谢老师,我再思考一下

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-18 22:50 , Processed in 0.218816 second(s), 20 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list