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[Multiwfn使用咨询] Multiwfn 生成的自旋密度的cube文件,如何用VMD绘制出特定效果

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本帖最后由 Gloria539 于 2021-7-8 10:15 编辑

这是是我用Multiwfn画的自旋密度图                             我想要的是这种效果的图片  
但是生成的cube文件,我用VMD打开是这样的,按照sob老师的博文用VMD绘制艺术级轨道等值面图的方法(含演示视频) - 思想家公社的门口:量子化学·分子模拟·二次元 (sobereva.com),我把VMDrender粘贴到VMD文本框中,图片效果并没有得到相应的改变。请问要怎么操作才能达到上图的效果呢?





























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发表于 Post on 2021-7-8 11:29:14 | 只看该作者 Only view this author
你要画自旋密度图,显然不能用绘制分子轨道的脚本

这里都有现成的把Multiwfn产生的cube文件在VMD里绘图的脚本
在VMD里将cube文件瞬间绘制成效果极佳的等值面图的方法
http://sobereva.com/483http://bbs.keinsci.com/thread-13329-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-7-8 15:26:49 | 只看该作者 Only view this author
解决了,谢谢老师!

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发表于 Post on 2021-7-10 21:10:32 | 只看该作者 Only view this author
Gloria539 发表于 2021-7-8 15:26
解决了,谢谢老师!

楼主您好,请问VMD目录下的 vmd.rc文件怎么用文本编辑器打开。为什么我每次打开,他都说我找不到文件。

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发表于 Post on 2021-7-10 22:40:09 | 只看该作者 Only view this author
XLD 发表于 2021-7-10 21:10
楼主您好,请问VMD目录下的 vmd.rc文件怎么用文本编辑器打开。为什么我每次打开,他都说我找不到文件。

文本编辑器直接打开就完了
如果VMD装在了默认目录下,换个目录再试。强烈不建议装在C盘的默认路径下。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2021-7-11 08:50:13 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-7-10 22:40
文本编辑器直接打开就完了
如果VMD装在了默认目录下,换个目录再试。强烈不建议装在C盘的默认路径下。

解决了 谢谢sob老师

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-7-11 16:25:24 | 只看该作者 Only view this author
XLD 发表于 2021-7-10 21:10
楼主您好,请问VMD目录下的 vmd.rc文件怎么用文本编辑器打开。为什么我每次打开,他都说我找不到文件。

我直接从Multiwfn下的scripts中把vmd.rc 复制过来,是可以打开的。

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发表于 Post on 2021-7-14 14:07:41 | 只看该作者 Only view this author
我的也是这个问题,不知道为什么?究竟是哪个地方不对?楼主,加个QQ问下,1719520151

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