水层的厚度是否会影响ROA的intensity

cuihongqiang · 发表于 Post on 2021-8-6 11:24:35

我想问下在计算过程中截取水层的厚度是否会影响ROA光谱的intensity,如图中，绿色为计算所得，蓝色为实验数据，有没有可能通过增加水层得厚度来使蓝色框中得绿色峰整体下移

sobereva · 发表于 Post on 2021-8-6 11:28:20

不管问什么问题都要把体系特征交代清楚

cuihongqiang · 发表于 Post on 2021-8-6 11:33:43

本帖最后由 cuihongqiang 于 2021-8-6 11:39 编辑

C:\Users\HP\Desktop\NAC.tif

cuihongqiang · 发表于 Post on 2021-8-6 11:41:19

cuihongqiang 发表于 2021-8-6 11:33

这个是我做的半胱胺酸分子，我现在是从动力学模拟中抽去2A内的水，我想问下这个水层厚度会不会有影响

喵星大佬 · 发表于 Post on 2021-8-6 14:34:51

你知道截取水层你不知道把抽取多个构象么。。。难道实验可以指测一个特定构象的？还是说你觉得你的分子只有一种构象

sobereva · 发表于 Post on 2021-8-6 22:19:30

显然可能。自行测试一下截取不同距离的结果便知

另外，这个不是单个的半胱氨酸分子

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[新手求助] 水层的厚度是否会影响ROA的intensity