分子对接后用Pymol可视化和同一文件用moe可视化显示出的氢键为什么不一样？

Mozzie · 发表于 Post on 2021-5-7 20:28:14

如下图，我是选择了to any atoms出现可能产生的氢键比在moe中出现的氢键多，这是为什么？
还有想请问大佬们，pymol可视化对接结果显示氢键选择哪个是to any atoms还是to other atoms in object还是其他两个选项呢？这四个选项有什么区别呀？
顺便问一下pymol可视化对接结果如何显示小分子在蛋白的口袋surface？

喵星大佬 · 发表于 Post on 2021-8-8 04:58:06

判定标准不一样(角度，长度)，而且都不算合理

5撇到3撇 · 发表于 Post on 2021-8-8 09:40:38

我看有说选择的是TO any atoms这个选项

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[分子对接] 分子对接后用Pymol可视化和同一文件用moe可视化显示出的氢键为什么不一样？

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