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[新手求助] 对比反应的不同进攻方向,起始反应物能量怎么选?

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本帖最后由 jw227 于 2021-8-26 17:32 编辑

对比一个反应的两个不同方向进攻,从过渡态得到的反应物能量不同,拆开反应物分别计算,然后再加和,所得到的能量也不同,如果平行对比,需要将起始产物的能量作为0,但是两种方法的能量都不一样,我的主要问题是,反应中反应物分别计算再加和,和过渡态得到的起始反应物复合物,哪个一般作为起始产物计算能量作为起点。如果平行对比一个反应的两个路线,起始能量像上述所讲,不一样,怎么来选啊?如果能量图中,可不可以直接就用两种反应物加和就可以,即:反应物a(单算,不从Ts得到反应物)+反应物b(单算)--------------------过渡态-------------------------------产物c(单算,不从Ts得到产物)+产物d(单算)----------------------------过渡态-------------------------产物e(单算)+产物f(单算),这样做的话,不就是只要找到过渡态就行了嘛,不用费那么大的劲去在从过渡态分别得到反应物和产物了,不知道大家是怎么做的?

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发表于 Post on 2021-8-26 18:34:28 | 只看该作者 Only view this author
分别计算 单算的两个反应物 和 与过渡态直接相连的反应复合物,看哪个自由能最低,就统一取那个物种的能量。注意即使比较的是能量,也需要通过自由能来判断取哪个的能量,而不是通过能量来选。
这个方法的前提是不同的反应复合物之间是快平衡。如果不满足这个条件,就比较麻烦了,得先确认反应的决速步
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-8-26 18:37:25 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 jw227 于 2021-8-26 18:40 编辑

老师,1.需要通过自由能来判断取哪个的能量,而不是通过能量来选---------------------------就是单点算的自由能吧
2.这个方法的前提是不同的反应复合物之间是快平衡。如果不满足这个条件,就比较麻烦了,得先确认反应的决速步-------------------确定反应决速步,然后怎么做呢,如何判断是快慢平衡?

这两个不太懂,能否详细地说下呢

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发表于 Post on 2021-8-26 19:45:31 | 只看该作者 Only view this author
jw227 发表于 2021-8-26 11:37
老师,1.需要通过自由能来判断取哪个的能量,而不是通过能量来选---------------------------就是单点算的 ...

1. 单点能加自由能校正,自由能校正在结构优化的级别下做freq计算得到
2. 假设A和B都可以反应得到C,A和B是快平衡的充要条件是A、B互相转换的过渡态的自由能低于【A反应成C的过渡态的自由能】和【B反应成C的过渡态的自由能】之中较低的那个
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
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