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[GROMACS] 关于副本交换的副本数和cpu核数

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目前我要做一个45个副本的副本交换,我看教程说使用的核数必须是副本数的整数倍,但我的电脑只有一个12核cpu,20线程(我不太懂核数啊线程数啊这些有什么联系),是不是意味着跑不了了?那像这种几十个副本的情况是不是只能租服务器才能跑得起来了?
另外GPU对这里的情况能不能起到什么帮助?

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发表于 Post on 2022-8-5 13:04:14 | 只看该作者 Only view this author
跑不了,另外副本交换动力学对GPU得显存也有要求,副本过多得话,显存和cpu核数都需要相应得增加

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-8-5 14:42:03 | 只看该作者 Only view this author
casea 发表于 2022-8-5 13:04
跑不了,另外副本交换动力学对GPU得显存也有要求,副本过多得话,显存和cpu核数都需要相应得增加

谢谢解答,我还想问一下,那我租云服务器来做这个可行吗,我不太懂这个东西怎么弄,以前在学校里的时候是把文件传到学校服务器上,上面装了gromacs,那国内我租服务器的话是租了之后自己在上面装GROMACS吗

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发表于 Post on 2022-8-5 17:51:34 | 只看该作者 Only view this author
bdx 发表于 2022-8-5 14:42
谢谢解答,我还想问一下,那我租云服务器来做这个可行吗,我不太懂这个东西怎么弄,以前在学校里的时候是 ...

一般的服务器都会给你预装好不同版本得gmx,你可以咨询客户经理

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