计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 14102|回复 Reply: 8
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[综合交流] 请教在服务器里安装处理转移积分的J_from_g03程序的问题

[复制链接 Copy URL]

255

帖子

0

威望

2270

eV
积分
2525

Level 5 (御坂)

之前看过sob老师的一个答贴,想处理转移积分的,http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=1142里面用的软件,下载后安装,过程是:先把压缩包解压,所有文件拷到服务器的文件夹下,然后安装,老出错,导致任务算不了,想请问各位老师问题出在哪里,怎么解决。谢谢赐教!
                


报错.png (8.87 KB, 下载次数 Times of downloads: 49)

报错.png

文件夹.png (3.04 KB, 下载次数 Times of downloads: 38)

文件夹.png

压缩包.png (2.44 KB, 下载次数 Times of downloads: 46)

压缩包.png

readme.png (7.25 KB, 下载次数 Times of downloads: 39)

压缩包内的readme文件

压缩包内的readme文件

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112551

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2016-1-5 15:51:21 | 只看该作者 Only view this author
这是我以前的J_from_g03安装笔记
编译方法:在trunk目录里,将Makefile里~/bin改成/usr/local/bin。将components.h的include部分改为
#include <iostream>
#include <fstream>
#include <stdio.h>
#include <string.h>
#include <cstdlib>
然后make即可。默认的g++就能编译。

运行需要octave,可以用yum install octave安装
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

255

帖子

0

威望

2270

eV
积分
2525

Level 5 (御坂)

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-1-5 21:12:30 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-1-5 15:51
这是我以前的J_from_g03安装笔记
编译方法:在trunk目录里,将Makefile里~/bin改成/usr/local/bin。将comp ...

十分感谢sob老师!正在按提示弄,谢谢老师!

255

帖子

0

威望

2270

eV
积分
2525

Level 5 (御坂)

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-1-5 21:46:45 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-1-5 15:51
这是我以前的J_from_g03安装笔记
编译方法:在trunk目录里,将Makefile里~/bin改成/usr/local/bin。将comp ...

老师你好,我下载了octave压缩包,解压以后上传到服务器中,用yum····安装,但是又另外出现了这些问题,不知道是哪里的原因,麻烦老师了!

报错.png (24.54 KB, 下载次数 Times of downloads: 58)

报错

报错

文件夹.PNG (5.92 KB, 下载次数 Times of downloads: 47)

文件夹

文件夹

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112551

管理员

公社社长

5#
发表于 Post on 2016-1-5 21:58:42 | 只看该作者 Only view this author
万卷书万里路 发表于 2016-1-5 21:46
老师你好,我下载了octave压缩包,解压以后上传到服务器中,用yum····安装,但是又另外出现了这些问 ...

不是报错,只是警告
只要能正常运行就不用管
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

255

帖子

0

威望

2270

eV
积分
2525

Level 5 (御坂)

6#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-1-5 22:06:25 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-1-5 21:58
不是报错,只是警告
只要能正常运行就不用管

奥,那请问老师,我就当它已经安装上了是吗?
然后我已经把makefile文件改好了,那就正常使用J_from_g03就行。
谢谢老师!

255

帖子

0

威望

2270

eV
积分
2525

Level 5 (御坂)

7#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-1-6 16:54:24 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 万卷书万里路 于 2016-1-6 17:01 编辑
sobereva 发表于 2016-1-5 21:58
不是报错,只是警告
只要能正常运行就不用管

sob老师你好!我在计算过程中发现了这个问题,是不是octave没安上,这就到计算的最后一步了,结果这样了···
之前的步骤都正常,那这个意思是不是octave只在最后一步出转移积分的售后发挥作用?
还有,这个结合之前的警告,是不是octave没安上,或者有什么特殊的要求吗,比如要编译或者放在指定位置?
谢谢!

错误.png (1.22 KB, 下载次数 Times of downloads: 32)

出现问题

出现问题

readme指示.PNG (5.64 KB, 下载次数 Times of downloads: 35)

readme指示.PNG

错误2.PNG (4.99 KB, 下载次数 Times of downloads: 33)

错误2.PNG

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112551

管理员

公社社长

8#
发表于 Post on 2016-1-6 17:53:55 | 只看该作者 Only view this author
就是octave没安装,所以没法按照.m脚本进行运算
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

255

帖子

0

威望

2270

eV
积分
2525

Level 5 (御坂)

9#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-1-6 18:31:06 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-1-6 17:53
就是octave没安装,所以没法按照.m脚本进行运算

恩,谢谢老师!那我重新安装试试

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-27 21:08 , Processed in 1.183225 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list