金属配离子力场参数问题

sun666 · 发表于 Post on 2021-10-10 21:42:25

请教老师，做金属配离子[Ni(NH3)6]2+的力场，用高斯做了结构优化以及频率振动分析。通过得到的力场数矩阵来做Ni离子与NH3的键长、二面角参数。使用Multiwfn对[Ni(NH3)6]2+计算了RESP电荷，但Ni离子电荷并不为+2价。此时用Merz的Ni2+的范德华参数还正确吗。（ps:优化后的结构Ni与NH3的N原子距离为2.08A，但是放入溶剂盒子跑动力学后距离变为1.08这是否正常）
是否有更优的做法。

sobereva · 发表于 Post on 2021-10-11 04:13:32

看此文搞清楚氧化态和原子电荷的区别
使用Multiwfn通过LOBA方法计算氧化态
http://sobereva.com/362（http://bbs.keinsci.com/thread-5118-1-1.html）

变为1.08埃显然不正常，明显参数有问题

sun666 · 发表于 Post on 2021-10-11 09:14:52

sobereva 发表于 2021-10-11 04:13
看此文搞清楚氧化态和原子电荷的区别
使用Multiwfn通过LOBA方法计算氧化态
http://sobereva.com/362（htt ...

谢谢社长，您的意思是我目前应该用氧化态而不应该使用RESP电荷是吗。

sobereva · 发表于 Post on 2021-10-11 14:21:42

sun666 发表于 2021-10-11 09:14
谢谢社长，您的意思是我目前应该用氧化态而不应该使用RESP电荷是吗。

做动力学肯定用RESP电荷，判断几价（确定中心金属的类型、状态）用LOBA算的氧化态

sun666 · 发表于 Post on 2021-10-11 16:34:05

sobereva 发表于 2021-10-11 14:21
做动力学肯定用RESP电荷，判断几价（确定中心金属的类型、状态）用LOBA算的氧化态

但是Merz的参数给的是单个Ni2+离子的。我用到配合物上（配合物中Ni电荷为1.2），这样不知道是否可行

sobereva · 发表于 Post on 2021-10-11 19:51:39

sun666 发表于 2021-10-11 16:34
但是Merz的参数给的是单个Ni2+离子的。我用到配合物上（配合物中Ni电荷为1.2），这样不知道是否可行

凑合

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