如何用VMD使结构中形成的氢键显示出来？

深爱小李 · 发表于 Post on 2021-10-13 14:20:21

导入由MS动力学模拟后转置过来的xyz格式的文件后，该怎么操作才能显示出结构中形成的氢键呢？

snljty · 发表于 Post on 2021-10-13 14:28:43

主菜单Graphics->Representations
点Create Rep
Drawing Method选HBonds，自己调一下右下角的识别标准和粗细等。
在论坛里随便搜VMD 显示氢键就有。

深爱小李 · 发表于 Post on 2021-10-13 14:37:34

snljty 发表于 2021-10-13 14:28
主菜单Graphics->Representations
点Create Rep
Drawing Method选HBonds，自己调一下右下角的识别标准和 ...

谢谢你的回复，我试过这样，但是只显示了氢键，我的药物结构不显示了，该怎么办呢

chema · 发表于 Post on 2021-10-13 16:45:52

深爱小李发表于 2021-10-13 14:37
谢谢你的回复，我试过这样，但是只显示了氢键，我的药物结构不显示了，该怎么办呢

没点Create Rep吧

深爱小李 · 发表于 Post on 2021-10-13 19:33:53

snljty 发表于 2021-10-13 14:28
主菜单Graphics->Representations
点Create Rep
Drawing Method选HBonds，自己调一下右下角的识别标准和 ...

谢谢你，解决啦

深爱小李 · 发表于 Post on 2021-10-13 19:34:20

chema 发表于 2021-10-13 16:45
没点Create Rep吧

确实是的，谢谢你

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