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[Gaussian/gview] gaussian16优化分子结构时加和不加opt=recalc=3得到的构型差别很大?

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我用Gaussian 16优化一个含有C,H,Se元素碗状分子的结构,先是用#p opt b3lyp/6-311g(d,p) geom=connectivity,得到了四个YES都收敛了,但是分子结构确是平面的。
然后我又用#p opt=recalc=3 b3lyp/6-311g(d,p) geom=connectivity算了一遍,同样得到了四个YES都收敛了,这一次分子的结构是碗状的。
请问为什么会有这么大的差别,这是不是意味着如果只做opt得到的结果是不可靠的。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-10-23 15:16:03 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 zhangzb 于 2021-10-23 15:24 编辑

补充:
基于这两个结构的频率计算结果:
1. 平面结构三个收敛,Maximum Displacement没有收敛,而且存在虚频;
2. 碗状结构四个都收敛,没有虚频。

另外,将上述分子中的Se原子换成S原子的另外一个分子,用#p opt freq b3lyp/6-311g(d,p) geom=connectivity和#p opt=recalc=3 freq b3lyp/6-311g(d,p) geom=connectivity分别计算的结果却是相同的。

我的问题是,以后优化分子结构的时候opt=recalc=n freq是不是成为必须的了,因为如果只用opt freq最后算出来虚频的话还是要再重新计算。
谢谢大家!

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发表于 Post on 2021-10-23 15:29:46 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 wzkchem5 于 2021-10-23 08:33 编辑
zhangzb 发表于 2021-10-23 08:16
补充:
基于这两个结构的频率计算结果:
1. 平面结构三个收敛,Maximum Displacement没有收敛,而且存在 ...

opt=recalc=n freq也不能严格保证没有虚频(除非n=1,但此时计算量太大)。本来结构优化就是有一定概率得到有虚频的结构,不能说一个优化方法有时会得到有虚频的结构,这个方法就是错的。用一个不保证没有虚频的方法优化,然后如果有虚频再消虚频,从概率上讲可能比用一个保证没有虚频的方法优化更快。
所以freq是必须的,检查有没有虚频、如果有的话把虚频消掉也是必须的,但recalc不是必须的。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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发表于 Post on 2021-10-23 15:38:28 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 fffff 于 2021-10-23 15:47 编辑

此回答只针对于“这是不是意味着如果只做opt得到的结果是不可靠的。”,这种体系没算过,不了解会不会有其他坑。
1.一般opt完需要在同一级别做freq检验有无虚频,从而判断是否处于极小点。opt顺利收敛≠结果有意义,比如H2O2直接用gview搭成平面结构去优化,opt能正常收敛,优化出平面结构,但是freq会显示有一个虚频,那这个平面结构就不是势能面上的极小点,需要破坏对称性后重新优化。
2.opt只能优化到离初猜结构最近的极小点,无法实现自动优化到全局极小点。大多体系拿局部极小点去研究某些性质显然不合理,优化到局部极小点的情况即便opt收敛,freq没虚频,结果也不能直接拿来用,需要做构象搜索,计算构象分布等操作。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-10-23 15:55:07 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-10-23 15:29
opt=recalc=n freq也不能严格保证没有虚频(除非n=1,但此时计算量太大)。本来结构优化就是有一定概率得 ...

受教,谢谢您!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-10-23 15:55:46 | 只看该作者 Only view this author
fffff 发表于 2021-10-23 15:38
此回答只针对于“这是不是意味着如果只做opt得到的结果是不可靠的。”,这种体系没算过,不了解会不会有其 ...

受教,谢谢您!

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