VMD制作背景虚化效果

qczgzly · 发表于 Post on 2016-9-23 17:45:29

本帖最后由 qczgzly 于 2016-9-23 17:45 编辑

　　三维渲染技术发展至今，正常的球棍模型图不再能够满足读者审美需求或提升文章档次。有没有高端路线可走呢？
　　突然想到了背景虚化。实现方法是VMD+POV-ray。主要思路是先用VMD制作生成分子三维结构图，render成POV-ray脚本，再向脚本中添加相关语句，渲染成最终作品。第一步生成POV-ray脚本的操作非常简单，VMD-->File-->Render对话框中选择POV-ray 3.6选项即可。下面主要说明POV-ray脚本中背景虚化相关语句。

camera{
angle 60 // perspective, do not use "orthographic"!
location <0.0000, 0.0000, -2.0000>
look_at <1.0, 0.5000, 2.0000>
up <0.0000, 3.0000, 0.0000>
right <-5.2510, 0.0000, 0.0000>
// focal blur settings:
focal_point <0.2706, 0.1153, -1.1833> // This point is in focus "sharp"
aperture 0.08 // 0.05 ~ 1.5, more = blurer
blur_samples 90 // 4 ~ 100, more = higher quality; fewer = faster
confidence 0.9 // 0.0 ~ 1.0, closeness to true color, more = closer
variance 1/256 // 1/46 ~ 1/1024, smallest displayable color difference
}

复制代码

其中focal_point是焦点，需要自己找。比较好的办法是自己加个标记，语句如下，效果如图中粉红色小球：

VMD_sphere(<0.2806, 0.1253, -1.1833>,0.02,rgbt<1.000,0.500,0.500,0.000>) // (<coordination x, y, z>, diameter, rgbcolor<r, g, b, t>)

复制代码

这个图想表达的主体是橙色虚线表示的分子间氢键，能看到周围环境和背景有点乱。另外aperture就是光圈的意思。以上代码和解释来源于http://www.f-lohmueller.de/pov_tut/camera_light/camera_e2.htm。
　　最终效果图：

sobereva · 发表于 Post on 2016-9-23 20:32:41

有用的技巧
我屏蔽背景原子一般是用VMD的雾化

ruanyang · 发表于 Post on 2016-9-24 08:29:46

好物啊！

yjmaxpayne · 发表于 Post on 2016-9-26 06:21:22

本帖最后由 yjmaxpayne 于 2016-9-26 16:04 编辑

Linux1.9.2以上版本下的Tachyon可以直接支持虚化，还可动态调节对焦位置和光圈大小，效果如下图所示：

但是建议配备一个在Linux下能够支持Cuda加速的卡，首选N卡。

加几句话： VMD版本需要下载包含了TachyonL-optiX的版本，在Display中可以找到DoF选项。打开后再在Render中选择TachyonL-OptiX即可。有兼容的GPU卡的话，可以选择 TachyonL-OptiX (interactive, GPU-accelerated)模式对光圈和对焦位置进行实时调节，方便出图。在Interactive模式下，可以任意旋转和缩放。需要注意的是，景深和虚化只有在Display模式设为Perspective的时候可用。

guoy14iccas · 发表于 Post on 2016-9-26 09:33:55

sob老师，想请教下ＶＭＤ雾化具体怎么操作？感觉您这个更方便些

sobereva · 发表于 Post on 2016-9-26 13:33:19

guoy14iccas 发表于 2016-9-26 09:33
sob老师，想请教下ＶＭＤ雾化具体怎么操作？感觉您这个更方便些

Display-Display settings里面把Cue Mode设成Linear，然后调Cue Start和Cue End，这设定雾化从哪里到哪里线性增强，逐渐调节，让这个范围较好覆盖背景原子的区域即可。

guoy14iccas · 发表于 Post on 2016-9-26 16:36:03

sobereva 发表于 2016-9-26 13:33
Display-Display settings里面把Cue Mode设成Linear，然后调Cue Start和Cue End，这设定雾化从哪里到哪 ...

好的，谢谢老师。

qczgzly · 发表于 Post on 2016-9-29 19:02:34

yjmaxpayne 发表于 2016-9-26 06:21
Linux1.9.2以上版本下的Tachyon可以直接支持虚化，还可动态调节对焦位置和光圈大小，效果如下图所示：

...

哇，这样就更方便了。谢谢~

zq2426851351 · 发表于 Post on 2016-10-19 22:40:58

学习了, 虽然暂时用不到

jluZ · 发表于 Post on 2021-2-27 18:02:25

老师，这里分享的代码和解释来源目前无法访问，http://www.f-lohmueller.de/pov_tut/camera_light/camera_e2.html，您还有其他网址吗？

Scenery · 发表于 Post on 2021-9-22 13:47:55

sobereva 发表于 2016-9-26 13:33
Display-Display settings里面把Cue Mode设成Linear，然后调Cue Start和Cue End，这设定雾化从哪里到哪 ...

老师，用这个方法加上tachyon，渲染出来的图片还是会带有雾化设定之外的内容，如何解决呢？

sobereva · 发表于 Post on 2021-9-23 05:06:42

Scenery 发表于 2021-9-22 13:47
老师，用这个方法加上tachyon，渲染出来的图片还是会带有雾化设定之外的内容，如何解决呢？

Tachyon渲染出来的和OpenGL窗口看到的往往会有一定差异，只能自己反复调节Display settings以及Graphics - Representation里的参数使得渲染出来的图和期望的效果一致，要么就别用Tachyon

nianbin · 发表于 Post on 2021-11-5 00:54:52

配色能不能分享一下

suihg · 发表于 Post on 2021-11-5 08:58:52

学习了，好东西

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