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[Material Studio] MS模拟MOF材料对C6烷烃的吸附,烷烃的联合立场模型该怎么简历呢

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刚接触,小白一个,希望各位老师解答。

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发表于 Post on 2021-11-17 02:35:35 | 只看该作者 Only view this author
我并不用M$,但没有理由非要用联合原子力场
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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发表于 Post on 2021-11-17 17:56:00 | 只看该作者 Only view this author
mesocite粗粒化,martini力场跑动力学
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-11-18 14:18:41 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-11-17 02:35
我并不用M$,但没有理由非要用联合原子力场

好的,我再研究一下,谢谢老师

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-11-18 14:20:49 | 只看该作者 Only view this author
naoki 发表于 2021-11-17 17:56
mesocite粗粒化,martini力场跑动力学

请问这样做的依据是什么呢,我刚接触不是很了解。

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发表于 Post on 2021-11-18 14:28:19 | 只看该作者 Only view this author
ziyouren 发表于 2021-11-18 14:20
请问这样做的依据是什么呢,我刚接触不是很了解。

不好意思啊我瞎了,你是要做联合力场,我看成粗粒化了。俺觉得你这个体系不需要用联合力场,全原子分子力场就好了
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-11-18 15:00:39 | 只看该作者 Only view this author
naoki 发表于 2021-11-18 14:28
不好意思啊我瞎了,你是要做联合力场,我看成粗粒化了。俺觉得你这个体系不需要用联合力场,全原子分子力 ...

谢谢老师的解答,我很想知道这些力场是怎么建立的,比如我这C6烷烃,我看文献中会有一些键伸缩参数,扭转参数,这些都是在哪设置或者修改的呢,我只是用MS模拟一下C6烷烃的吸附过程做一下论文,但又因为刚接触,好些问题不知道该从哪下手。

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发表于 Post on 2021-11-18 16:51:31 | 只看该作者 Only view this author
ziyouren 发表于 2021-11-18 15:00
谢谢老师的解答,我很想知道这些力场是怎么建立的,比如我这C6烷烃,我看文献中会有一些键伸缩参数,扭转 ...

非要用M$的话,Forcite模块可以选择自己定义或下载的格式合适的力场。导入之后如果你想手动修改力场参数,也可以用Forcite模块里面的Forcefield manager改。别的俺也不懂了
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-11-18 18:11:31 | 只看该作者 Only view this author
naoki 发表于 2021-11-18 16:51
非要用M$的话,Forcite模块可以选择自己定义或下载的格式合适的力场。导入之后如果你想手动修改力场参数 ...

非常感谢!

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发表于 Post on 2021-11-19 05:17:56 | 只看该作者 Only view this author
ziyouren 发表于 2021-11-18 15:00
谢谢老师的解答,我很想知道这些力场是怎么建立的,比如我这C6烷烃,我看文献中会有一些键伸缩参数,扭转 ...

直接用COMPASS之类力场就完了,力场参数会自动分配
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-11-22 10:13:43 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-11-19 05:17
直接用COMPASS之类力场就完了,力场参数会自动分配

好的谢谢老师

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