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[CP2K] 石墨烯负载金属原子体系使用TZVP级别的基组算结构优化后的能量,可以忽略BSSE设置吗

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本帖最后由 1764360701 于 2024-3-27 09:17 编辑

最近在做一个负载两个金属原子的slab,用来吸附一个N2分子。CP2K软件包算的,打算用几何结构优化后的能量来计算这个slab对N2分子的吸附能,体系共有五十个原子。由于计算经验不足,导致我目前计算出现了一些疑问,希望老师可以给一些建议。
输入文件都是用的Multiwfn产生的,然后自己稍加修改,基组是用的TZVP-MOLOPT-GTH的,这种体系周期性我设置的是XY,真空层设置的是15 ai。最近在考虑结构优化出来的能量的准确性问题,结构优化能跑,用的对角化算法配合SMEAR  k点取的 2,2,1。并且收敛效果理想。
1.请问用这样的基组算几何结构优化后的能量还要考虑BSSE的误差吗?
2.只设置XY方向的周期性是否合理?
3.关于K点的选取,X和Y方向的晶胞边长分别是10 ai和9 ai,K点选取2,2,1是否合理?Z方向应该不需要考虑设置k点吧。
真的很感谢能帮助到我的每一个老师,谢谢

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发表于 Post on 2024-3-23 10:39:11 | 只看该作者 Only view this author
基组名必须完整写全,否则TZVP谁知道你是指pob-TZVP还是TZVP-GTH还是TZVP-MOLOPT-GTH还是Ahlrichs-def2-TZVP
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-3-23 10:55:33 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-3-23 10:39
基组名必须完整写全,否则TZVP谁知道你是指pob-TZVP还是TZVP-GTH还是TZVP-MOLOPT-GTH还是Ahlrichs-def2-TZV ...

老师,已修改

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发表于 Post on 2024-3-23 12:19:20 | 只看该作者 Only view this author
1 不用。但当前体系不大,可以用更好的TZV2P-MOLOPT-GTH
2 合理
3 埃不要写成ai,看着难受死了
3,3,1更好
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-3-23 17:31:48 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-3-23 12:19
1 不用。但当前体系不大,可以用更好的TZV2P-MOLOPT-GTH
2 合理
3 埃不要写成ai,看着难受死了

谢谢老师的指导

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-3-23 18:00:15 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-3-23 12:19
1 不用。但当前体系不大,可以用更好的TZV2P-MOLOPT-GTH
2 合理
3 埃不要写成ai,看着难受死了

老师您好,在.inp文件里Ti这个元素报错没有找到TZV2P-MOLOPT-GTH这个基组,然后我发现Ti元素有TZV2P-MOLOPT-PBE-GTH这个基组,然后我用TZV2P-MOLOPT-PBE-GTH-q12,也就是混合基组,造成的结果误差影响大吗?谢谢老师。

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发表于 Post on 2024-3-23 21:31:57 | 只看该作者 Only view this author
1764360701 发表于 2024-3-23 18:00
老师您好,在.inp文件里Ti这个元素报错没有找到TZV2P-MOLOPT-GTH这个基组,然后我发现Ti元素有TZV2P-MOLO ...

MOLOPT基组尽量都用同一个基组文件里的,不要诸如原始的MOLOPT、UZH的MOLOPT、UCL的MOLOPT基组文件里定义的混用
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-3-23 22:59:25 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-3-23 21:31
MOLOPT基组尽量都用同一个基组文件里的,不要诸如原始的MOLOPT、UZH的MOLOPT、UCL的MOLOPT基组文件里定义 ...

就是比如说我某一个元素用的BASIS_MOLOPT_UZH文件夹里的基组,那么其他元素也尽量要用这个文件夹里的基组,是这个意思吗老师

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发表于 Post on 2024-3-24 11:05:46 | 只看该作者 Only view this author
1764360701 发表于 2024-3-23 22:59
就是比如说我某一个元素用的BASIS_MOLOPT_UZH文件夹里的基组,那么其他元素也尽量要用这个文件夹里的基组 ...

虽然没有绝对要求,但最好如此,否则显得莫名其妙
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-3-25 09:32:47 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-3-24 11:05
虽然没有绝对要求,但最好如此,否则显得莫名其妙

好的,感谢老师指导

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