中间体优化，得到的结构式另一个中间体，如果修改输入文件该如何修改？

zhining · 发表于 Post on 2022-1-7 16:27:06

求问，使用Gaussian 09优化PNP催化剂上含甲酸的结构，N上的H一直拔不掉应该怎么做。比如我设好甲酸HCOOH，O…H……N距离分别为0.9埃，和2.8埃。最后H和N还是连上的。这种应该如何才可以优化出来啊？谢谢大家（结构如文献里的图A3）

wzkchem5 · 发表于 Post on 2022-1-7 16:31:58

做一个柔性扫描，验证一下H是不是只能在N上。可能H在甲酸上的结构根本不存在，不是你优化方法的问题，而是客观上不存在

zhining · 发表于 Post on 2022-1-7 17:24:00

wzkchem5 发表于 2022-1-7 16:31
做一个柔性扫描，验证一下H是不是只能在N上。可能H在甲酸上的结构根本不存在，不是你优化方法的问题，而是 ...

嗯嗯，我先尝试一下，谢谢。之前做过刚性扫描

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