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[NBO相关] 布居分析相关问题

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楼主
从小木虫追到这,是个量化小白,恳请赐教。
1.Gaussview中NBO输入中选择full NBO,就等同于关键词pop=NBO,进行NBO轨道分析计算,看到网上有些例子中加入POP=full这个关键词,查了一下这个关键词是指输出全部轨道分析,想请教下POP=full和pop=NBO算出来的有什么不同,在算pop=NBO时加上POP=full有什么用吗?
2. 检查点文件保存的时候有4个选项:不保存,savenbo,  saveNLMO,  savemixed,这样得到的输出文件有什么不同,一般做NBO分析常保存那一种?查了一下NLMO是指自然局域化轨道,不理解和NBO有什么不同。
概念比较混乱,也不是很懂,表拍

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发表于 Post on 2016-2-23 17:02:31 | 只看该作者 Only view this author
pop=full仅仅是把所有分子轨道(MO)的系数打印出来,和你目前谈到的NBO分析没有任何关系。
pop=NBO是做NBO分析,建议先看http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=102里面的入门资料了解些NBO分析的基础。弄清楚NBO分析框架中的NAO、NHO、NBO、NLMO都是什么,以及NBO/NLMO与MO在特点上的区别。

默认情况下是把MO保存到chk文件里。pop=savenbo是把NBO分析得到的NBO轨道保存到chk里,saveNLMO就是保存NLMO,savemixed一般不用。应当先弄清楚你的目的何在,如果目的是观看NBO轨道图形,看此文的说明
使用Multiwfn绘制NBO及相关轨道
http://sobereva.com/134


北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-2-23 20:20:41 | 只看该作者 Only view this author
非常感谢大神,在思想家公社看到你的一些文章,感觉很多东西都比以前明白的。我是学化工的,但是有时也需要用量化的东西来解释实验现象,所以看很多东西似懂非懂的。打算多看下你推荐的资料,一天天进步。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-2-23 20:44:07 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 dxyan 于 2016-2-23 21:35 编辑
sobereva 发表于 2016-2-23 17:02
pop=full仅仅是把所有分子轨道(MO)的系数打印出来,和你目前谈到的NBO分析没有任何关系。
pop=NBO是做NBO ...

1. 此外,还有些问题不太明白。按您所说pop=full是算出所有的分子轨道(MO),POP=nbo算的是自然键轨道,默认情况下是把MO保存到chk文件里,pop=savenbo是把NBO分析得到的NBO轨道保存到chk里,两者存入chk文件的目的主要是为了图形可视化吧?我目前只想通过NBO分析算相互NPA电荷布局,再一个想通过两分子复合物的NBO分析得到轨道键的二阶稳定化能来判断相互作用力。基于我这个目的是不是只要输入POP=nbo,保存就选don't save就行了吧?因为不需要做轨道图形,只想从输出文件中得到二阶稳定化能。
2. 我看到网上有些文件,POP=nbo和pop=full同时使用,这样做是为什么呢?3.另外我看到有别人算NBO,也就是算点单能的时候,进场会加上scf=tight。我一般都是在优化和频率做好后的分子结构上再算单点能+NBO的,不明白这个时候加scf=tight的目的是什么?
非常感谢您耐心回答。

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发表于 Post on 2016-2-23 21:28:34 | 只看该作者 Only view this author
dxyan 发表于 2016-2-23 20:44
1. 此外,还有些问题不太明白。按您所说pop=full是算出所有的分子轨道(MO),POP=nbo算的是自然键轨道, ...


1 不管你写不写pop=full,MO都是肯定要算出来的,只不过pop=full把详细信息(展开系数)输出出来,默认不输出是因为太占地方。
轨道存入chk一方面是作为可视化,另一方面可以作为之后计算用的初猜轨道。
对于你的目的pop=NBO就够了。

2 不要盲目效仿别人的输入文件。自己需要干什么就用什么关键词。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-2-23 21:43:13 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-2-23 21:28
1 不管你写不写pop=full,MO都是肯定要算出来的,只不过pop=full把详细信息(展开系数)输出出来,默认 ...

谢谢soberevade 回复,到你这总能得到非常确实的回复

PS:签名档很赞

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