求助：Pb(II)乙酸配合物出现小虚频无法消去

kcnco · 发表于 Post on 2025-8-25 15:29:38

本帖最后由 kcnco 于 2025-8-25 16:11 编辑

各位老师好，如题，我在进行Pb(II)乙酸配合物(携带6个H2O)的限制性几何优化及振动分析时出现~ -9.45的虚频始终无法消去(已尝试了http://sobereva.com/278中的所有方法)，输入文件关键词如下(其中surface=sas)：
#p opt=(calcall,tight) scrf=read def2svp em=gd3 int=superfine pbe1pbe
最终opt、freq输出均为4个yes，但小虚频始终存在。请问各位老师，是由于我的初始结构存在明显问题吗，还是因为采用了surface=sas或是限制性几何优化会对后续的振动分析有影响？
以下是输入及输出文件：

Pb-6-sas.gjf (1.76 KB, 下载次数 Times of downloads: 6)

Pb-6-sas.out (492.77 KB, 下载次数 Times of downloads: 6)

wal · 发表于 Post on 2025-8-25 17:06:54

冻结优化是可能会引入消不掉的虚频但是你这个有必要冻结吗

kcnco · 发表于 Post on 2025-8-25 17:21:35

wal 发表于 2025-8-25 17:06
冻结优化是可能会引入消不掉的虚频但是你这个有必要冻结吗

谢谢老师，因为我这个初始结构是从蛋白质的MD中截取出来的氨基酸侧链，想要为了保证蛋白质骨架的稳定因此采用了冻结优化。

sobereva · 发表于 Post on 2025-8-26 05:03:42

只冻结一个原子本质上和没冻结没区别，本来体系就可以任意整体移动

去掉冻结再试。若仍有虚频，该怎么消怎么消，不可能有按照278博文消不掉的。

另外，如果是在溶剂环境中，没理由Pb处于配位不饱和状态。

kcnco · 发表于 Post on 2025-8-26 10:32:30

sobereva 发表于 2025-8-26 05:03
只冻结一个原子本质上和没冻结没区别，本来体系就可以任意整体移动

去掉冻结再试。若仍有虚频，该怎么消 ...

非常感谢sob老师的解答，去除冻结后虚频消去

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