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[波函数分析求助] 画IFCT分析的电荷转移矩阵热图求助

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  尝试sobereva老师介绍的“使用Multiwfn绘制跃迁密度矩阵和电荷转移矩阵考察电子激发特征(含视频)”方法用origin画电荷转移矩阵热图,例子里得到的tmat.txt文件的数据格式根据sobereva老师的介绍说明在origin里很容易转换成矩阵,并画出TDM的热图;但是atmCTmat.txt文件中数据格式不同于前者,导入到origin后,不知道如何转成矩阵,好电荷转移矩阵热图,盼望指教。         

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发表于 Post on 2022-2-18 19:41:03 | 只看该作者 Only view this author
进入主功能18的子功能2 Plot atom/fragment transition matrix of various kinds as heat map,载入atmCTmat.txt,之后选3 Export transition density matrix to tmat.txt in current folder导出,就是三列的形式了
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-2-18 20:21:52 | 只看该作者 Only view this author
十分感谢Sob老师的详细解答。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-2-18 21:40:06 | 只看该作者 Only view this author
    Sob老师,我按照上面讲解“进入主功能18的子功能2 Plot atom/fragment transition matrix of various kinds as heat map,载入atmCTmat.txt,之后选3 Export transition density matrix to tmat.txt in current folder导出,就是三列的形式了”操作后,变成三列了,但是atmCTmat.txt文件输出有效数字比tmat.txt输出有效数字要大两位,这样tmat.txt输出数据四舍五入就不准了,不知道如何能使得tmat.txt输出更多位有效数字。

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发表于 Post on 2022-2-18 21:43:17 | 只看该作者 Only view this author
dashuo 发表于 2022-2-18 14:40
Sob老师,我按照上面讲解“进入主功能18的子功能2 Plot atom/fragment transition matrix of various ki ...

本身热图就是一个定性分析工具,不需要那么准
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
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ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-2-18 21:55:14 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-2-18 21:43
本身热图就是一个定性分析工具,不需要那么准

明白了,有道理,感谢啊

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