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[波函数分析求助] 使用Multiwfn和VMD画阴离子分子静电势图,确定抗衡离子位置时遇到的问题

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大家好,我用Multiwfn结合VMD画阴离子的分子静电势图,绘制的具体结构是P2W18O62-6(一种多金属氧酸盐结构,整体化合价是-6价),想通过画MEP图确定抗衡离子的位置,使得整体呈现电中性。具体操作http://sobereva.com/443使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图)。但是在计算过程中遇到了一些问题,想请教一下各位老师。1.绘制阴离子的分子静电势图后,应该根据极小值里面最小的得六个数值标定抗衡离子的位置,还是要根据所有数值,在极大值和极小值里选择数值最小的六个数值?


2.分子静电势图里的极大值和极小值具体含义是什么?为什么有些极大值的数据要小于极小值的数据?
下图是我绘制的图形,以及surfanalysis.pdb文件信息。



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2#
发表于 Post on 2022-3-2 03:53:11 | 只看该作者 Only view this author
1 找静电势最负的六个表面极值点

2 超级详细的Multiwfn手册里都写得明明白白



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