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[新手求助] 甲基叔丁基酮与正戊醇协同萃取苯酚负离子计算的基组选择求助

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楼主
各位老师,想请教一下,用甲基叔丁基酮与正戊醇协同萃取苯酚负离子 3个分子共50个原子 只有C、H、O,不知道基组可以这样选择吗(%nprocshared=52  %mem=104GB)
优化 #p opt freq b3lyp/6-311+g** scrf pop=savenbo em=gd3bj
单点能 #p M06-2X ma-def2-TZAP scrf em=gd3bj

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发表于 Post on 2022-3-10 15:45:22 | 只看该作者 Only view this author
ma-def2-TZVP拼错了,另外这个基组高斯应该不支持,应该需要手动输入基组定义
结构优化不要加pop=savenbo,白白浪费时间(因为结构优化中途的NBO分析结果你几乎肯定是不需要的),如果一定需要做NBO分析,单点计算的时候再加
M06-2X不能配合em=gd3bj,只能配合em=gd3
此外建议在计算的时候也考虑阳离子,因为不可能只萃取阴离子,一定会把等量的阳离子也萃取出来,那么阳离子的分配系数对萃取总分配系数的贡献肯定会很大,不能忽略
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-3-10 17:13:36 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-3-10 15:45
ma-def2-TZVP拼错了,另外这个基组高斯应该不支持,应该需要手动输入基组定义
结构优化不要加pop=savenbo ...

非常感谢您的回复,之前单点能一直用rb3lyp/6-311++g(d,p),对M06-2X还不太了解,基组定义是直接在输入文件中加入吗
为了提高酚的萃取率,想从酚的解离上考虑,离子态的酚易溶于水,想找出能够与离子态酚结合的萃取剂,但考虑阳离子的话不知道从哪方面入手

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发表于 Post on 2022-3-10 17:27:29 | 只看该作者 Only view this author
reddy 发表于 2022-3-10 10:13
非常感谢您的回复,之前单点能一直用rb3lyp/6-311++g(d,p),对M06-2X还不太了解,基组定义是直接在输入文 ...

自定义ma系列基组的方法参见http://sobereva.com/509
阳离子需要你自己去查文献,看看一般萃取有机负离子(未必是酚负离子)用什么阳离子
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
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发表于 Post on 2022-3-10 19:55:29 | 只看该作者 Only view this author
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,并清楚、准确反映出帖子具体内容,避免有任何歧义,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题“基组选择”改了,以后务必注意,下次将删帖+扣分处理。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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发表于 Post on 2022-3-10 19:58:15 | 只看该作者 Only view this author
那叫ma-def2-TZVP不叫ma-def2-TZAP

仔细看此文搞清楚为什么M06-2X不能用em=gd3bj
DFT-D色散校正的使用
http://sobereva.com/210

没事甭写pop=savenbo,对你的研究根本就没什么意义,而且此时得到的fch文件没法给Multiwfn用于考察弱相互作用、静电势等对研究当前问题真正有意义的分析
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-3-10 20:27:19 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-3-10 19:58
那叫ma-def2-TZVP不叫ma-def2-TZAP

仔细看此文搞清楚为什么M06-2X不能用em=gd3bj

嗯嗯 谢谢您的指正

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