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[PSI4] PSI4进行分子内相互作用的SAPT计算,输入文件编写问题

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老师,看到您在一个帖子里面回复过PSI4可以支持分子内相互作用SAPT的计算,我现在想要尝试分析分子内的pi-pi相互作用,看您http://sobereva.com/526这个上面给的是分子间的操作,我自己类比做了一下分子内的,操作如下图,想请您检查一下我做的理解的对不对?

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发表于 Post on 2022-3-13 06:56:11 | 只看该作者 Only view this author
明显不合理。必须自己把两个苯环截取出来,边缘加氢饱和,当二聚体算
要不然C6H4是个电子结构诡异的体系,根本代表不了当前体系中苯环部分
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-3-13 12:15:42 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 mhliu 于 2022-3-13 12:17 编辑
sobereva 发表于 2022-3-13 06:56
明显不合理。必须自己把两个苯环截取出来,边缘加氢饱和,当二聚体算
要不然C6H4是个电子结构诡异的体系, ...

好的,老师,那我可以理解成我要是想计算其他类型分子内弱相互作用也都要截取出来加氢后当做分子间的二聚体来处理吗?那这样分子间和分子内就没区别了吧?
我开始是看到了这篇文章https://pubs.acs.org/doi/full/10.1021/acs.jpclett.9b01220,里面说用PSI4分析了分子内(如下图),这个也是取出片段加氢后当做分子间二聚体来做吗?C:\Users\mhLiu\Desktop

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发表于 Post on 2022-3-14 02:05:30 | 只看该作者 Only view this author
mhliu 发表于 2022-3-13 12:15
好的,老师,那我可以理解成我要是想计算其他类型分子内弱相互作用也都要截取出来加氢后当做分子间的二聚 ...

F-SAPT和SAPT根本不是一码事
Multiwfn创建的是后者的输入文件
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-3-14 09:52:55 | 只看该作者 Only view this author
好的,不好意思老师。刚接触SAPT,相关知识还没有了解充分,谢谢老师提醒
老师,我在PSI4的手册上找到一个F-SAPT的输入文件,我复制下来去运行了一下。出现报错(见附件),请问老师帮忙看一下原因和我需要如何修改,谢谢老师

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