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[GROMACS] 关于iacpype.py生成配体itp文件失败的求助

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各位老师好,我想使用acpype.py处理配体文件,配体文件里面存在一个芳香环。
指令为./acpype.py -i UDP_GAL.pdb -d,结果在运行过程中报错,报错信息如下

之后又尝试了指令./acpype.py -i UDP_GAL.mol2 -c user -d,还是报错。

请问各位老师该怎么解决?

随贴附上我的文件 UDP_GAL.pdb (9.95 KB, 下载次数 Times of downloads: 0) UDP_GAL.mol2 (6.05 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)






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发表于 Post on 2022-3-14 16:41:46 | 只看该作者 Only view this author

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发表于 Post on 2022-3-15 01:52:39 | 只看该作者 Only view this author
标题写错了,这是acpype.py不是iacpype.py

如今没任何必要再用acpype了,Sobtop灵活好用强大得多,看http://sobereva.com/soft/Sobtop

帖子里不要自己写[求助]这种标签,http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html里特意说了。给你去了
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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